Protein–RNA interactions for Protein: Q8NCB2

CAMKV, CaM kinase-like vesicle-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMKVQ8NCB2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAMKVQ8NCB2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CAMKVQ8NCB2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CAMKVQ8NCB2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAMKVQ8NCB2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAMKVQ8NCB2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAMKVQ8NCB2 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CAMKVQ8NCB2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CAMKVQ8NCB2 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAMKVQ8NCB2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CAMKVQ8NCB2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAMKVQ8NCB2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAMKVQ8NCB2 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAMKVQ8NCB2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAMKVQ8NCB2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CAMKVQ8NCB2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAMKVQ8NCB2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAMKVQ8NCB2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAMKVQ8NCB2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAMKVQ8NCB2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CAMKVQ8NCB2 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAMKVQ8NCB2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAMKVQ8NCB2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CAMKVQ8NCB2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CAMKVQ8NCB2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAMKVQ8NCB2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAMKVQ8NCB2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAMKVQ8NCB2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
CAMKVQ8NCB2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CAMKVQ8NCB2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAMKVQ8NCB2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAMKVQ8NCB2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAMKVQ8NCB2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAMKVQ8NCB2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAMKVQ8NCB2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAMKVQ8NCB2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CAMKVQ8NCB2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAMKVQ8NCB2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAMKVQ8NCB2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CAMKVQ8NCB2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAMKVQ8NCB2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CAMKVQ8NCB2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAMKVQ8NCB2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CAMKVQ8NCB2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
CAMKVQ8NCB2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
CAMKVQ8NCB2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAMKVQ8NCB2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAMKVQ8NCB2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
CAMKVQ8NCB2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAMKVQ8NCB2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAMKVQ8NCB2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAMKVQ8NCB2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAMKVQ8NCB2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
CAMKVQ8NCB2 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAMKVQ8NCB2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAMKVQ8NCB2 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAMKVQ8NCB2 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CAMKVQ8NCB2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAMKVQ8NCB2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
CAMKVQ8NCB2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
CAMKVQ8NCB2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAMKVQ8NCB2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAMKVQ8NCB2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAMKVQ8NCB2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAMKVQ8NCB2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAMKVQ8NCB2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
CAMKVQ8NCB2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAMKVQ8NCB2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAMKVQ8NCB2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAMKVQ8NCB2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
CAMKVQ8NCB2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAMKVQ8NCB2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
CAMKVQ8NCB2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAMKVQ8NCB2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAMKVQ8NCB2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
CAMKVQ8NCB2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAMKVQ8NCB2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAMKVQ8NCB2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
CAMKVQ8NCB2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
CAMKVQ8NCB2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAMKVQ8NCB2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAMKVQ8NCB2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAMKVQ8NCB2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAMKVQ8NCB2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
CAMKVQ8NCB2 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAMKVQ8NCB2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAMKVQ8NCB2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
CAMKVQ8NCB2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAMKVQ8NCB2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAMKVQ8NCB2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAMKVQ8NCB2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
CAMKVQ8NCB2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAMKVQ8NCB2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAMKVQ8NCB2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
CAMKVQ8NCB2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAMKVQ8NCB2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAMKVQ8NCB2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAMKVQ8NCB2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAMKVQ8NCB2 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
CAMKVQ8NCB2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 108.5 ms