Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC51

SERBP1, Plasminogen activator inhibitor 1 RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERBP1Q8NC51 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.173e-18■■■■■ 45
SERBP1Q8NC51 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 12e-6■■■■■ 44.8
SERBP1Q8NC51 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.722e-6■■■■■ 44.8
SERBP1Q8NC51 HDGF-205ENST00000469145 844 ntTSL 220.32■□□□□ 0.843e-9■■■■■ 44.6
SERBP1Q8NC51 HDGF-209ENST00000495212 744 ntTSL 319.02■□□□□ 0.643e-9■■■■■ 44.6
SERBP1Q8NC51 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.718e-8■■■■■ 44.5
SERBP1Q8NC51 MAP7D1-213ENST00000532131 771 ntTSL 524.62■■□□□ 1.538e-8■■■■■ 44.5
SERBP1Q8NC51 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.488e-8■■■■■ 44.5
SERBP1Q8NC51 RHEB-205ENST00000478470 1153 ntTSL 523.89■■□□□ 1.418e-8■■■■■ 44.5
SERBP1Q8NC51 MAPRE3-203ENST00000405074 1801 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.998e-8■■■■■ 44.5
SERBP1Q8NC51 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.78e-8■■■■■ 44.5
SERBP1Q8NC51 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.598e-8■■■■■ 44.5
SERBP1Q8NC51 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.548e-8■■■■■ 44.5
SERBP1Q8NC51 FSCN1-202ENST00000405801 550 ntTSL 418.14■□□□□ 0.498e-8■■■■■ 44.5
SERBP1Q8NC51 FSCN1-204ENST00000447103 713 ntTSL 418.01■□□□□ 0.478e-8■■■■■ 44.5
SERBP1Q8NC51 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.338e-8■■■■■ 44.5
SERBP1Q8NC51 FSCN1-203ENST00000444748 580 ntTSL 317.09■□□□□ 0.338e-8■■■■■ 44.5
SERBP1Q8NC51 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.238e-8■■■■■ 44.5
SERBP1Q8NC51 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.158e-8■■■■■ 44.5
SERBP1Q8NC51 MAPRE3-206ENST00000475633 1160 ntTSL 215.96■□□□□ 0.158e-8■■■■■ 44.5
SERBP1Q8NC51 SCAP-202ENST00000320017 3430 ntTSL 215.5■□□□□ 0.078e-8■■■■■ 44.5
SERBP1Q8NC51 SCAP-207ENST00000441517 3748 ntTSL 215.39■□□□□ 0.058e-8■■■■■ 44.5
SERBP1Q8NC51 SCAP-206ENST00000428413 3749 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.058e-8■■■■■ 44.5
SERBP1Q8NC51 GCLM-204ENST00000615724 3008 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 08e-8■■■■■ 44.5
SERBP1Q8NC51 MAPRE3-209ENST00000494788 574 ntTSL 214.44□□□□□ -0.18e-8■■■■■ 44.5
SERBP1Q8NC51 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC14.1□□□□□ -0.158e-8■■■■■ 44.5
SERBP1Q8NC51 HIST1H4E-201ENST00000615164 1487 ntAPPRIS P1 BASIC7.64□□□□□ -1.198e-8■■■■■ 44.5
SERBP1Q8NC51 SETD5-209ENST00000431285 1824 ntTSL 524.26■■□□□ 1.477e-8■■■■■ 44.2
SERBP1Q8NC51 SETD5-212ENST00000450326 921 ntTSL 314.94□□□□□ -0.027e-8■■■■■ 44.2
SERBP1Q8NC51 SETD5-203ENST00000402198 6827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.667e-8■■■■■ 44.2
SERBP1Q8NC51 GNAS-209ENST00000371081 730 ntTSL 2 BASIC12.03□□□□□ -0.481e-42■■■■■ 44.1
SERBP1Q8NC51 GNAS-202ENST00000306090 477 ntTSL 5 BASIC5.48□□□□□ -1.531e-42■■■■■ 44.1
SERBP1Q8NC51 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.211e-7■■■■■ 44.1
SERBP1Q8NC51 FKBP8-204ENST00000596015 612 ntTSL 316.56■□□□□ 0.241e-7■■■■■ 44.1
SERBP1Q8NC51 FKBP8-205ENST00000596494 439 ntTSL 316.5■□□□□ 0.231e-7■■■■■ 44.1
SERBP1Q8NC51 KDELR2-206ENST00000490996 655 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.446e-23■■■■■ 43.8
SERBP1Q8NC51 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.51e-7■■■■■ 43.8
SERBP1Q8NC51 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.411e-7■■■■■ 43.8
SERBP1Q8NC51 AXIN1-205ENST00000481769 1089 ntTSL 325.06■■□□□ 1.61e-9■■■■■ 42.9
SERBP1Q8NC51 GNB2-203ENST00000393926 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.413e-6■■■■■ 42.9
SERBP1Q8NC51 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.274e-6■■■■■ 42.9
SERBP1Q8NC51 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.953e-6■■■■■ 42.9
SERBP1Q8NC51 GNB2-212ENST00000470354 902 ntTSL 519.26■□□□□ 0.673e-6■■■■■ 42.9
SERBP1Q8NC51 LTBP4-212ENST00000595118 2446 ntTSL 217.86■□□□□ 0.451e-9■■■■■ 42.9
SERBP1Q8NC51 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.451e-9■■■■■ 42.9
SERBP1Q8NC51 LTBP4-204ENST00000318809 1700 ntTSL 217.53■□□□□ 0.41e-9■■■■■ 42.9
SERBP1Q8NC51 GNB2-211ENST00000469287 1702 ntTSL 215.37■□□□□ 0.053e-6■■■■■ 42.9
SERBP1Q8NC51 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.053e-6■■■■■ 42.9
SERBP1Q8NC51 LTBP4-220ENST00000598166 699 ntTSL 515□□□□□ -0.011e-9■■■■■ 42.9
SERBP1Q8NC51 AXIN1-202ENST00000354866 3324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.311e-9■■■■■ 42.9
SERBP1Q8NC51 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.362e-6■■■■■ 42.6
SERBP1Q8NC51 WNK1-201ENST00000315939 10452 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.113e-6■■■■■ 42.1
SERBP1Q8NC51 WNK1-202ENST00000340908 11208 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.333e-6■■■■■ 42.1
SERBP1Q8NC51 WNK1-209ENST00000537687 11232 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.333e-6■■■■■ 42.1
SERBP1Q8NC51 WNK1-204ENST00000530271 11804 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.553e-6■■■■■ 42.1
SERBP1Q8NC51 EIF3B-203ENST00000413917 962 ntTSL 219.6■□□□□ 0.732e-11■■■■■ 41.9
SERBP1Q8NC51 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.712e-11■■■■■ 41.9
SERBP1Q8NC51 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.532e-11■■■■■ 41.9
SERBP1Q8NC51 EIF3B-204ENST00000431643 1074 ntTSL 516.31■□□□□ 0.22e-11■■■■■ 41.9
SERBP1Q8NC51 BAG6-245ENST00000437771 2407 ntTSL 515.94■□□□□ 0.142e-7■■■■■ 41.9
SERBP1Q8NC51 BAG6-247ENST00000439687 3104 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.292e-7■■■■■ 41.9
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SERBP1Q8NC51 BAG6-236ENST00000375964 3815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.512e-7■■■■■ 41.9
SERBP1Q8NC51 BAG6-237ENST00000375976 3644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.82□□□□□ -0.522e-7■■■■■ 41.9
SERBP1Q8NC51 BAG6-234ENST00000211379 3779 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.552e-7■■■■■ 41.9
SERBP1Q8NC51 MDH2-202ENST00000424167 681 ntTSL 211.7□□□□□ -0.541e-6■■■■■ 41.9
SERBP1Q8NC51 TRIM28-207ENST00000597136 1552 ntTSL 214.87□□□□□ -0.031e-6■■■■■ 41.8
SERBP1Q8NC51 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.76e-7■■■■■ 41.8
SERBP1Q8NC51 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.656e-7■■■■■ 41.8
SERBP1Q8NC51 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.656e-7■■■■■ 41.8
SERBP1Q8NC51 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.516e-7■■■■■ 41.8
SERBP1Q8NC51 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.456e-7■■■■■ 41.8
SERBP1Q8NC51 TUBA1B-201ENST00000332858 3198 ntTSL 1 (best)13.71□□□□□ -0.212e-6■■■■■ 41.7
SERBP1Q8NC51 TUBA1B-202ENST00000336023 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.222e-6■■■■■ 41.7
SERBP1Q8NC51 TUBA1B-204ENST00000547765 1875 ntTSL 513.6□□□□□ -0.232e-6■■■■■ 41.7
SERBP1Q8NC51 TUBA1B-206ENST00000550367 835 ntTSL 39.09□□□□□ -0.952e-6■■■■■ 41.7
SERBP1Q8NC51 ADAMTSL4-202ENST00000369038 4167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.318e-8■■■■■ 41.6
SERBP1Q8NC51 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.372e-6■■■■■ 41.2
SERBP1Q8NC51 BLVRB-204ENST00000601346 676 ntTSL 211.99□□□□□ -0.493e-7■■■■■ 40.7
SERBP1Q8NC51 USP14-208ENST00000582707 1803 ntTSL 5 BASIC13.31□□□□□ -0.287e-8■■■■■ 40.4
SERBP1Q8NC51 USP14-202ENST00000383589 2168 ntTSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.517e-8■■■■■ 40.4
SERBP1Q8NC51 USP14-206ENST00000580410 474 ntTSL 411.61□□□□□ -0.557e-8■■■■■ 40.4
SERBP1Q8NC51 USP14-203ENST00000400266 1681 ntTSL 2 BASIC11.52□□□□□ -0.577e-8■■■■■ 40.4
SERBP1Q8NC51 USP14-205ENST00000578942 3189 ntTSL 210.93□□□□□ -0.667e-8■■■■■ 40.4
SERBP1Q8NC51 USP14-201ENST00000261601 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.7□□□□□ -1.027e-8■■■■■ 40.4
SERBP1Q8NC51 ATP1B3-205ENST00000475483 734 ntTSL 314.47□□□□□ -0.095e-11■■■■■ 40.1
SERBP1Q8NC51 ATP1B3-201ENST00000286371 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.195e-11■■■■■ 40.1
SERBP1Q8NC51 ATP1B3-203ENST00000465172 1951 ntTSL 28.01□□□□□ -1.135e-11■■■■■ 40.1
SERBP1Q8NC51 HBM-202ENST00000472539 592 ntTSL 520.32■□□□□ 0.843e-23■■■■■ 40
SERBP1Q8NC51 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.393e-23■■■■■ 40
SERBP1Q8NC51 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.654e-8■■■■■ 39.6
SERBP1Q8NC51 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.389e-7■■■■■ 39.5
SERBP1Q8NC51 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.169e-7■■■■■ 39.5
SERBP1Q8NC51 KHDRBS1-201ENST00000307714 2738 ntTSL 1 (best)19.22■□□□□ 0.674e-8■■■■■ 39.4
SERBP1Q8NC51 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.224e-8■■■■■ 39.4
SERBP1Q8NC51 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.82e-6■■■■■ 39.4
SERBP1Q8NC51 GATA1-202ENST00000376670 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.92e-7■■■■■ 38.6
SERBP1Q8NC51 GATA1-201ENST00000376665 1140 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.52e-7■■■■■ 38.6
SERBP1Q8NC51 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.661e-6■■■■■ 38.1
SERBP1Q8NC51 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.061e-6■■■■■ 38.1
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