Protein–RNA interactions for Protein: Q8N7C3

TRIML2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase TRIML2, humanhuman

Predictions only

Length 387 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIML2Q8N7C3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIML2Q8N7C3 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIML2Q8N7C3 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIML2Q8N7C3 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIML2Q8N7C3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIML2Q8N7C3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIML2Q8N7C3 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIML2Q8N7C3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIML2Q8N7C3 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIML2Q8N7C3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIML2Q8N7C3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIML2Q8N7C3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIML2Q8N7C3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIML2Q8N7C3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIML2Q8N7C3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIML2Q8N7C3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIML2Q8N7C3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIML2Q8N7C3 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIML2Q8N7C3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIML2Q8N7C3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIML2Q8N7C3 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIML2Q8N7C3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIML2Q8N7C3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIML2Q8N7C3 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIML2Q8N7C3 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIML2Q8N7C3 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIML2Q8N7C3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIML2Q8N7C3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIML2Q8N7C3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIML2Q8N7C3 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIML2Q8N7C3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIML2Q8N7C3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIML2Q8N7C3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIML2Q8N7C3 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIML2Q8N7C3 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIML2Q8N7C3 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIML2Q8N7C3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIML2Q8N7C3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIML2Q8N7C3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIML2Q8N7C3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIML2Q8N7C3 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIML2Q8N7C3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIML2Q8N7C3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIML2Q8N7C3 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIML2Q8N7C3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIML2Q8N7C3 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIML2Q8N7C3 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIML2Q8N7C3 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIML2Q8N7C3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIML2Q8N7C3 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIML2Q8N7C3 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIML2Q8N7C3 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIML2Q8N7C3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIML2Q8N7C3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIML2Q8N7C3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIML2Q8N7C3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIML2Q8N7C3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIML2Q8N7C3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIML2Q8N7C3 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIML2Q8N7C3 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIML2Q8N7C3 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIML2Q8N7C3 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIML2Q8N7C3 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIML2Q8N7C3 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIML2Q8N7C3 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIML2Q8N7C3 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIML2Q8N7C3 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIML2Q8N7C3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIML2Q8N7C3 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIML2Q8N7C3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIML2Q8N7C3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIML2Q8N7C3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIML2Q8N7C3 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRIML2Q8N7C3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRIML2Q8N7C3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRIML2Q8N7C3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIML2Q8N7C3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIML2Q8N7C3 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIML2Q8N7C3 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIML2Q8N7C3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIML2Q8N7C3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIML2Q8N7C3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIML2Q8N7C3 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIML2Q8N7C3 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIML2Q8N7C3 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIML2Q8N7C3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIML2Q8N7C3 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIML2Q8N7C3 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIML2Q8N7C3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIML2Q8N7C3 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIML2Q8N7C3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIML2Q8N7C3 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIML2Q8N7C3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIML2Q8N7C3 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIML2Q8N7C3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIML2Q8N7C3 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIML2Q8N7C3 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIML2Q8N7C3 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIML2Q8N7C3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIML2Q8N7C3 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.7 ms