Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2K1

UBE2J2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 J2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2J2Q8N2K1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
UBE2J2Q8N2K1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE2J2Q8N2K1 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE2J2Q8N2K1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE2J2Q8N2K1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE2J2Q8N2K1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE2J2Q8N2K1 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE2J2Q8N2K1 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
UBE2J2Q8N2K1 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE2J2Q8N2K1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE2J2Q8N2K1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE2J2Q8N2K1 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE2J2Q8N2K1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE2J2Q8N2K1 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
UBE2J2Q8N2K1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE2J2Q8N2K1 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
UBE2J2Q8N2K1 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE2J2Q8N2K1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE2J2Q8N2K1 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
UBE2J2Q8N2K1 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE2J2Q8N2K1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE2J2Q8N2K1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE2J2Q8N2K1 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
UBE2J2Q8N2K1 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE2J2Q8N2K1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE2J2Q8N2K1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE2J2Q8N2K1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE2J2Q8N2K1 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE2J2Q8N2K1 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE2J2Q8N2K1 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
UBE2J2Q8N2K1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE2J2Q8N2K1 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE2J2Q8N2K1 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE2J2Q8N2K1 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
UBE2J2Q8N2K1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE2J2Q8N2K1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE2J2Q8N2K1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE2J2Q8N2K1 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE2J2Q8N2K1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE2J2Q8N2K1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
UBE2J2Q8N2K1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE2J2Q8N2K1 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE2J2Q8N2K1 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE2J2Q8N2K1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
UBE2J2Q8N2K1 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE2J2Q8N2K1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
UBE2J2Q8N2K1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE2J2Q8N2K1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE2J2Q8N2K1 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
UBE2J2Q8N2K1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE2J2Q8N2K1 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE2J2Q8N2K1 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE2J2Q8N2K1 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE2J2Q8N2K1 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
UBE2J2Q8N2K1 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
UBE2J2Q8N2K1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE2J2Q8N2K1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE2J2Q8N2K1 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE2J2Q8N2K1 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
UBE2J2Q8N2K1 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE2J2Q8N2K1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE2J2Q8N2K1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE2J2Q8N2K1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE2J2Q8N2K1 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE2J2Q8N2K1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE2J2Q8N2K1 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE2J2Q8N2K1 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE2J2Q8N2K1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
UBE2J2Q8N2K1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE2J2Q8N2K1 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE2J2Q8N2K1 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE2J2Q8N2K1 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
UBE2J2Q8N2K1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE2J2Q8N2K1 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE2J2Q8N2K1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE2J2Q8N2K1 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
UBE2J2Q8N2K1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.24
UBE2J2Q8N2K1 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
UBE2J2Q8N2K1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE2J2Q8N2K1 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE2J2Q8N2K1 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE2J2Q8N2K1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE2J2Q8N2K1 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
UBE2J2Q8N2K1 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE2J2Q8N2K1 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE2J2Q8N2K1 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE2J2Q8N2K1 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
UBE2J2Q8N2K1 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE2J2Q8N2K1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
UBE2J2Q8N2K1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE2J2Q8N2K1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE2J2Q8N2K1 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE2J2Q8N2K1 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE2J2Q8N2K1 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE2J2Q8N2K1 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE2J2Q8N2K1 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE2J2Q8N2K1 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE2J2Q8N2K1 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UBE2J2Q8N2K1 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UBE2J2Q8N2K1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms