Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2H9

PELI3, E3 ubiquitin-protein ligase pellino homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 469 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PELI3Q8N2H9 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PELI3Q8N2H9 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PELI3Q8N2H9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PELI3Q8N2H9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PELI3Q8N2H9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PELI3Q8N2H9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PELI3Q8N2H9 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PELI3Q8N2H9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PELI3Q8N2H9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PELI3Q8N2H9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PELI3Q8N2H9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PELI3Q8N2H9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PELI3Q8N2H9 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PELI3Q8N2H9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PELI3Q8N2H9 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PELI3Q8N2H9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PELI3Q8N2H9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PELI3Q8N2H9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PELI3Q8N2H9 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PELI3Q8N2H9 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PELI3Q8N2H9 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
PELI3Q8N2H9 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PELI3Q8N2H9 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PELI3Q8N2H9 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
PELI3Q8N2H9 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PELI3Q8N2H9 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
PELI3Q8N2H9 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PELI3Q8N2H9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
PELI3Q8N2H9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PELI3Q8N2H9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PELI3Q8N2H9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PELI3Q8N2H9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
PELI3Q8N2H9 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PELI3Q8N2H9 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PELI3Q8N2H9 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
PELI3Q8N2H9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PELI3Q8N2H9 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
PELI3Q8N2H9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PELI3Q8N2H9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PELI3Q8N2H9 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PELI3Q8N2H9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PELI3Q8N2H9 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PELI3Q8N2H9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PELI3Q8N2H9 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PELI3Q8N2H9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PELI3Q8N2H9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PELI3Q8N2H9 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PELI3Q8N2H9 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PELI3Q8N2H9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
PELI3Q8N2H9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PELI3Q8N2H9 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PELI3Q8N2H9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PELI3Q8N2H9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PELI3Q8N2H9 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PELI3Q8N2H9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
PELI3Q8N2H9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PELI3Q8N2H9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PELI3Q8N2H9 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PELI3Q8N2H9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PELI3Q8N2H9 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PELI3Q8N2H9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
PELI3Q8N2H9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PELI3Q8N2H9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PELI3Q8N2H9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PELI3Q8N2H9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PELI3Q8N2H9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PELI3Q8N2H9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
PELI3Q8N2H9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PELI3Q8N2H9 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PELI3Q8N2H9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PELI3Q8N2H9 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
PELI3Q8N2H9 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PELI3Q8N2H9 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PELI3Q8N2H9 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PELI3Q8N2H9 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PELI3Q8N2H9 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PELI3Q8N2H9 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PELI3Q8N2H9 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PELI3Q8N2H9 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PELI3Q8N2H9 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PELI3Q8N2H9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PELI3Q8N2H9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PELI3Q8N2H9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PELI3Q8N2H9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PELI3Q8N2H9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PELI3Q8N2H9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PELI3Q8N2H9 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PELI3Q8N2H9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PELI3Q8N2H9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PELI3Q8N2H9 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PELI3Q8N2H9 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PELI3Q8N2H9 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PELI3Q8N2H9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PELI3Q8N2H9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
PELI3Q8N2H9 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PELI3Q8N2H9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PELI3Q8N2H9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PELI3Q8N2H9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PELI3Q8N2H9 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PELI3Q8N2H9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms