Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWT6

LRRC8A, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8A, humanhuman

Predictions only

Length 810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8AQ8IWT6 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRC8AQ8IWT6 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRC8AQ8IWT6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRC8AQ8IWT6 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
LRRC8AQ8IWT6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC8AQ8IWT6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
LRRC8AQ8IWT6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC8AQ8IWT6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC8AQ8IWT6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC8AQ8IWT6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC8AQ8IWT6 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
LRRC8AQ8IWT6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRC8AQ8IWT6 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRC8AQ8IWT6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRC8AQ8IWT6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRC8AQ8IWT6 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRC8AQ8IWT6 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRC8AQ8IWT6 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRC8AQ8IWT6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRC8AQ8IWT6 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
LRRC8AQ8IWT6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
LRRC8AQ8IWT6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
LRRC8AQ8IWT6 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
LRRC8AQ8IWT6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC8AQ8IWT6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC8AQ8IWT6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC8AQ8IWT6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC8AQ8IWT6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
LRRC8AQ8IWT6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRC8AQ8IWT6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRC8AQ8IWT6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
LRRC8AQ8IWT6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC8AQ8IWT6 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC8AQ8IWT6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC8AQ8IWT6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
LRRC8AQ8IWT6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
LRRC8AQ8IWT6 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC8AQ8IWT6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC8AQ8IWT6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC8AQ8IWT6 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC8AQ8IWT6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
LRRC8AQ8IWT6 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRC8AQ8IWT6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
LRRC8AQ8IWT6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
LRRC8AQ8IWT6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
LRRC8AQ8IWT6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC8AQ8IWT6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC8AQ8IWT6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC8AQ8IWT6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC8AQ8IWT6 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC8AQ8IWT6 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
LRRC8AQ8IWT6 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC8AQ8IWT6 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC8AQ8IWT6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
LRRC8AQ8IWT6 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC8AQ8IWT6 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC8AQ8IWT6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC8AQ8IWT6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC8AQ8IWT6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC8AQ8IWT6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.59■■■□□ 2.01
LRRC8AQ8IWT6 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRC8AQ8IWT6 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
LRRC8AQ8IWT6 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRRC8AQ8IWT6 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LRRC8AQ8IWT6 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LRRC8AQ8IWT6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRRC8AQ8IWT6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
LRRC8AQ8IWT6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LRRC8AQ8IWT6 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
LRRC8AQ8IWT6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRRC8AQ8IWT6 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
LRRC8AQ8IWT6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRRC8AQ8IWT6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
LRRC8AQ8IWT6 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
LRRC8AQ8IWT6 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LRRC8AQ8IWT6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
LRRC8AQ8IWT6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LRRC8AQ8IWT6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
LRRC8AQ8IWT6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC8AQ8IWT6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC8AQ8IWT6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC8AQ8IWT6 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC8AQ8IWT6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC8AQ8IWT6 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
LRRC8AQ8IWT6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC8AQ8IWT6 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC8AQ8IWT6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC8AQ8IWT6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC8AQ8IWT6 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC8AQ8IWT6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
LRRC8AQ8IWT6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
LRRC8AQ8IWT6 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
LRRC8AQ8IWT6 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC27.51■■■□□ 2
LRRC8AQ8IWT6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC8AQ8IWT6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
LRRC8AQ8IWT6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC8AQ8IWT6 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
LRRC8AQ8IWT6 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRC8AQ8IWT6 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
LRRC8AQ8IWT6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms