Protein–RNA interactions for Protein: Q8IVF7

FMNL3, Formin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,028 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FMNL3Q8IVF7 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FMNL3Q8IVF7 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FMNL3Q8IVF7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FMNL3Q8IVF7 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FMNL3Q8IVF7 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
FMNL3Q8IVF7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
FMNL3Q8IVF7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
FMNL3Q8IVF7 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
FMNL3Q8IVF7 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
FMNL3Q8IVF7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
FMNL3Q8IVF7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FMNL3Q8IVF7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FMNL3Q8IVF7 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
FMNL3Q8IVF7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FMNL3Q8IVF7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
FMNL3Q8IVF7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
FMNL3Q8IVF7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FMNL3Q8IVF7 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FMNL3Q8IVF7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FMNL3Q8IVF7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
FMNL3Q8IVF7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FMNL3Q8IVF7 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FMNL3Q8IVF7 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
FMNL3Q8IVF7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
FMNL3Q8IVF7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FMNL3Q8IVF7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
FMNL3Q8IVF7 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FMNL3Q8IVF7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
FMNL3Q8IVF7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FMNL3Q8IVF7 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
FMNL3Q8IVF7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
FMNL3Q8IVF7 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FMNL3Q8IVF7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FMNL3Q8IVF7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FMNL3Q8IVF7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
FMNL3Q8IVF7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
FMNL3Q8IVF7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FMNL3Q8IVF7 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
FMNL3Q8IVF7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FMNL3Q8IVF7 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
FMNL3Q8IVF7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.31■■□□□ 1.96
FMNL3Q8IVF7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FMNL3Q8IVF7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
FMNL3Q8IVF7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
FMNL3Q8IVF7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
FMNL3Q8IVF7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
FMNL3Q8IVF7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
FMNL3Q8IVF7 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FMNL3Q8IVF7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FMNL3Q8IVF7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
FMNL3Q8IVF7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
FMNL3Q8IVF7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FMNL3Q8IVF7 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FMNL3Q8IVF7 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
FMNL3Q8IVF7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
FMNL3Q8IVF7 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FMNL3Q8IVF7 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
FMNL3Q8IVF7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FMNL3Q8IVF7 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
FMNL3Q8IVF7 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FMNL3Q8IVF7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
FMNL3Q8IVF7 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FMNL3Q8IVF7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FMNL3Q8IVF7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
FMNL3Q8IVF7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
FMNL3Q8IVF7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
FMNL3Q8IVF7 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.24■■□□□ 1.95
FMNL3Q8IVF7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
FMNL3Q8IVF7 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FMNL3Q8IVF7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FMNL3Q8IVF7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FMNL3Q8IVF7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FMNL3Q8IVF7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FMNL3Q8IVF7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
FMNL3Q8IVF7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
FMNL3Q8IVF7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.22■■□□□ 1.95
FMNL3Q8IVF7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FMNL3Q8IVF7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
FMNL3Q8IVF7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FMNL3Q8IVF7 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FMNL3Q8IVF7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FMNL3Q8IVF7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.21■■□□□ 1.95
FMNL3Q8IVF7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
FMNL3Q8IVF7 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
FMNL3Q8IVF7 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
FMNL3Q8IVF7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FMNL3Q8IVF7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FMNL3Q8IVF7 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FMNL3Q8IVF7 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FMNL3Q8IVF7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
FMNL3Q8IVF7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
FMNL3Q8IVF7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
FMNL3Q8IVF7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FMNL3Q8IVF7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FMNL3Q8IVF7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FMNL3Q8IVF7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.17■■□□□ 1.94
FMNL3Q8IVF7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
FMNL3Q8IVF7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FMNL3Q8IVF7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
FMNL3Q8IVF7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms