Protein–RNA interactions for Protein: Q86YC2

PALB2, Partner and localizer of BRCA2, humanhuman

Predictions only

Length 1,186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PALB2Q86YC2 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PALB2Q86YC2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PALB2Q86YC2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PALB2Q86YC2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PALB2Q86YC2 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PALB2Q86YC2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PALB2Q86YC2 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
PALB2Q86YC2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
PALB2Q86YC2 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
PALB2Q86YC2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PALB2Q86YC2 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PALB2Q86YC2 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PALB2Q86YC2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
PALB2Q86YC2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PALB2Q86YC2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
PALB2Q86YC2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PALB2Q86YC2 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PALB2Q86YC2 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PALB2Q86YC2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
PALB2Q86YC2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PALB2Q86YC2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
PALB2Q86YC2 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PALB2Q86YC2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PALB2Q86YC2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PALB2Q86YC2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PALB2Q86YC2 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PALB2Q86YC2 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PALB2Q86YC2 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PALB2Q86YC2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PALB2Q86YC2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.02
PALB2Q86YC2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PALB2Q86YC2 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PALB2Q86YC2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PALB2Q86YC2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PALB2Q86YC2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PALB2Q86YC2 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PALB2Q86YC2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PALB2Q86YC2 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PALB2Q86YC2 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PALB2Q86YC2 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PALB2Q86YC2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PALB2Q86YC2 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PALB2Q86YC2 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PALB2Q86YC2 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PALB2Q86YC2 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PALB2Q86YC2 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PALB2Q86YC2 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PALB2Q86YC2 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PALB2Q86YC2 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PALB2Q86YC2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PALB2Q86YC2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PALB2Q86YC2 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PALB2Q86YC2 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PALB2Q86YC2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PALB2Q86YC2 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PALB2Q86YC2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PALB2Q86YC2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PALB2Q86YC2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PALB2Q86YC2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PALB2Q86YC2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
PALB2Q86YC2 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PALB2Q86YC2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PALB2Q86YC2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
PALB2Q86YC2 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PALB2Q86YC2 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
PALB2Q86YC2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
PALB2Q86YC2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PALB2Q86YC2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
PALB2Q86YC2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PALB2Q86YC2 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
PALB2Q86YC2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PALB2Q86YC2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
PALB2Q86YC2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
PALB2Q86YC2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PALB2Q86YC2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PALB2Q86YC2 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PALB2Q86YC2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PALB2Q86YC2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PALB2Q86YC2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PALB2Q86YC2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PALB2Q86YC2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
PALB2Q86YC2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
PALB2Q86YC2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PALB2Q86YC2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PALB2Q86YC2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PALB2Q86YC2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PALB2Q86YC2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PALB2Q86YC2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PALB2Q86YC2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PALB2Q86YC2 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PALB2Q86YC2 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PALB2Q86YC2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PALB2Q86YC2 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PALB2Q86YC2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
PALB2Q86YC2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PALB2Q86YC2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PALB2Q86YC2 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
PALB2Q86YC2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PALB2Q86YC2 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PALB2Q86YC2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 161.4 ms