Protein–RNA interactions for Protein: Q7L0L9

Transmembrane protein LOC653160, humanhuman

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q7L0L9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Q7L0L9 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC27.69■■■□□ 2.02
Q7L0L9 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC27.69■■■□□ 2.02
Q7L0L9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Q7L0L9 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
Q7L0L9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Q7L0L9 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
Q7L0L9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.68■■■□□ 2.02
Q7L0L9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Q7L0L9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Q7L0L9 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Q7L0L9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Q7L0L9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Q7L0L9 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Q7L0L9 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
Q7L0L9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
Q7L0L9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Q7L0L9 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
Q7L0L9 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Q7L0L9 ZEB1-AS1-205ENST00000605946 382 ntTSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Q7L0L9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Q7L0L9 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
Q7L0L9 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Q7L0L9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Q7L0L9 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
Q7L0L9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Q7L0L9 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Q7L0L9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Q7L0L9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
Q7L0L9 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Q7L0L9 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Q7L0L9 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Q7L0L9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Q7L0L9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Q7L0L9 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Q7L0L9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Q7L0L9 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Q7L0L9 AC103834.1-201ENST00000520383 144 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
Q7L0L9 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Q7L0L9 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Q7L0L9 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Q7L0L9 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Q7L0L9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Q7L0L9 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
Q7L0L9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
Q7L0L9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Q7L0L9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
Q7L0L9 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
Q7L0L9 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Q7L0L9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Q7L0L9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Q7L0L9 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Q7L0L9 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Q7L0L9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Q7L0L9 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
Q7L0L9 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Q7L0L9 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Q7L0L9 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Q7L0L9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Q7L0L9 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Q7L0L9 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.52■■■□□ 2
Q7L0L9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC27.52■■■□□ 2
Q7L0L9 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Q7L0L9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Q7L0L9 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Q7L0L9 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Q7L0L9 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Q7L0L9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Q7L0L9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Q7L0L9 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Q7L0L9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Q7L0L9 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Q7L0L9 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Q7L0L9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Q7L0L9 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
Q7L0L9 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Q7L0L9 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Q7L0L9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Q7L0L9 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Q7L0L9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Q7L0L9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Q7L0L9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Q7L0L9 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.45■■□□□ 1.99
Q7L0L9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Q7L0L9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Q7L0L9 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Q7L0L9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Q7L0L9 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Q7L0L9 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Q7L0L9 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Q7L0L9 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Q7L0L9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Q7L0L9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Q7L0L9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Q7L0L9 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Q7L0L9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Q7L0L9 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Q7L0L9 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Q7L0L9 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Q7L0L9 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.2 ms