Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZUS6

CCDC149, Coiled-coil domain-containing protein 149, humanhuman

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC149Q6ZUS6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC149Q6ZUS6 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC149Q6ZUS6 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.94■■□□□ 1.9
CCDC149Q6ZUS6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC149Q6ZUS6 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC149Q6ZUS6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
CCDC149Q6ZUS6 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC149Q6ZUS6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC149Q6ZUS6 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC149Q6ZUS6 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC149Q6ZUS6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
CCDC149Q6ZUS6 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC149Q6ZUS6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
CCDC149Q6ZUS6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC149Q6ZUS6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC149Q6ZUS6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC149Q6ZUS6 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC149Q6ZUS6 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC149Q6ZUS6 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC149Q6ZUS6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC149Q6ZUS6 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC149Q6ZUS6 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
CCDC149Q6ZUS6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC149Q6ZUS6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
CCDC149Q6ZUS6 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC149Q6ZUS6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC149Q6ZUS6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC149Q6ZUS6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC149Q6ZUS6 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
CCDC149Q6ZUS6 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
CCDC149Q6ZUS6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC149Q6ZUS6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC149Q6ZUS6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC149Q6ZUS6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC149Q6ZUS6 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC149Q6ZUS6 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC149Q6ZUS6 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
CCDC149Q6ZUS6 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC149Q6ZUS6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC149Q6ZUS6 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC149Q6ZUS6 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC149Q6ZUS6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC149Q6ZUS6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC149Q6ZUS6 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
CCDC149Q6ZUS6 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC149Q6ZUS6 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC149Q6ZUS6 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC149Q6ZUS6 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC149Q6ZUS6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
CCDC149Q6ZUS6 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC149Q6ZUS6 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
CCDC149Q6ZUS6 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC149Q6ZUS6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC149Q6ZUS6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC149Q6ZUS6 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC149Q6ZUS6 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC149Q6ZUS6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC149Q6ZUS6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC149Q6ZUS6 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC149Q6ZUS6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC149Q6ZUS6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
CCDC149Q6ZUS6 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC149Q6ZUS6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC149Q6ZUS6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
CCDC149Q6ZUS6 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
CCDC149Q6ZUS6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC149Q6ZUS6 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC149Q6ZUS6 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
CCDC149Q6ZUS6 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC149Q6ZUS6 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC149Q6ZUS6 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC149Q6ZUS6 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC149Q6ZUS6 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
CCDC149Q6ZUS6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC149Q6ZUS6 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
CCDC149Q6ZUS6 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC149Q6ZUS6 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC149Q6ZUS6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
CCDC149Q6ZUS6 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC149Q6ZUS6 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC149Q6ZUS6 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
CCDC149Q6ZUS6 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC149Q6ZUS6 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC149Q6ZUS6 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC149Q6ZUS6 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
CCDC149Q6ZUS6 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC149Q6ZUS6 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.73■■□□□ 1.87
CCDC149Q6ZUS6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC149Q6ZUS6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC149Q6ZUS6 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
CCDC149Q6ZUS6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
CCDC149Q6ZUS6 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC149Q6ZUS6 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC149Q6ZUS6 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
CCDC149Q6ZUS6 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC149Q6ZUS6 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC149Q6ZUS6 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
CCDC149Q6ZUS6 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC149Q6ZUS6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
CCDC149Q6ZUS6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms