Protein–RNA interactions for Protein: Q6PJF5

RHBDF2, Inactive rhomboid protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RHBDF2Q6PJF5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RHBDF2Q6PJF5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RHBDF2Q6PJF5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
RHBDF2Q6PJF5 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RHBDF2Q6PJF5 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
RHBDF2Q6PJF5 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
RHBDF2Q6PJF5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RHBDF2Q6PJF5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RHBDF2Q6PJF5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
RHBDF2Q6PJF5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
RHBDF2Q6PJF5 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
RHBDF2Q6PJF5 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
RHBDF2Q6PJF5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RHBDF2Q6PJF5 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RHBDF2Q6PJF5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RHBDF2Q6PJF5 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RHBDF2Q6PJF5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RHBDF2Q6PJF5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RHBDF2Q6PJF5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RHBDF2Q6PJF5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RHBDF2Q6PJF5 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
RHBDF2Q6PJF5 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RHBDF2Q6PJF5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RHBDF2Q6PJF5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RHBDF2Q6PJF5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RHBDF2Q6PJF5 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RHBDF2Q6PJF5 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RHBDF2Q6PJF5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RHBDF2Q6PJF5 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RHBDF2Q6PJF5 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RHBDF2Q6PJF5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RHBDF2Q6PJF5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
RHBDF2Q6PJF5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RHBDF2Q6PJF5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RHBDF2Q6PJF5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RHBDF2Q6PJF5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RHBDF2Q6PJF5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RHBDF2Q6PJF5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RHBDF2Q6PJF5 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RHBDF2Q6PJF5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RHBDF2Q6PJF5 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RHBDF2Q6PJF5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
RHBDF2Q6PJF5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RHBDF2Q6PJF5 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
RHBDF2Q6PJF5 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RHBDF2Q6PJF5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RHBDF2Q6PJF5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RHBDF2Q6PJF5 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RHBDF2Q6PJF5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RHBDF2Q6PJF5 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RHBDF2Q6PJF5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RHBDF2Q6PJF5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RHBDF2Q6PJF5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RHBDF2Q6PJF5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
RHBDF2Q6PJF5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
RHBDF2Q6PJF5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RHBDF2Q6PJF5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
RHBDF2Q6PJF5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RHBDF2Q6PJF5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RHBDF2Q6PJF5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RHBDF2Q6PJF5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
RHBDF2Q6PJF5 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
RHBDF2Q6PJF5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RHBDF2Q6PJF5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RHBDF2Q6PJF5 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RHBDF2Q6PJF5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
RHBDF2Q6PJF5 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RHBDF2Q6PJF5 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RHBDF2Q6PJF5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RHBDF2Q6PJF5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
RHBDF2Q6PJF5 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
RHBDF2Q6PJF5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RHBDF2Q6PJF5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
RHBDF2Q6PJF5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
RHBDF2Q6PJF5 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RHBDF2Q6PJF5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
RHBDF2Q6PJF5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
RHBDF2Q6PJF5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RHBDF2Q6PJF5 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RHBDF2Q6PJF5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
RHBDF2Q6PJF5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RHBDF2Q6PJF5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RHBDF2Q6PJF5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RHBDF2Q6PJF5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RHBDF2Q6PJF5 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RHBDF2Q6PJF5 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RHBDF2Q6PJF5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RHBDF2Q6PJF5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RHBDF2Q6PJF5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RHBDF2Q6PJF5 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RHBDF2Q6PJF5 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RHBDF2Q6PJF5 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RHBDF2Q6PJF5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RHBDF2Q6PJF5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RHBDF2Q6PJF5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RHBDF2Q6PJF5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RHBDF2Q6PJF5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RHBDF2Q6PJF5 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RHBDF2Q6PJF5 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RHBDF2Q6PJF5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms