Protein–RNA interactions for Protein: Q6PCB8

EMB, Embigin, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMBQ6PCB8 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
EMBQ6PCB8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EMBQ6PCB8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
EMBQ6PCB8 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
EMBQ6PCB8 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
EMBQ6PCB8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
EMBQ6PCB8 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
EMBQ6PCB8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
EMBQ6PCB8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
EMBQ6PCB8 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EMBQ6PCB8 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EMBQ6PCB8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EMBQ6PCB8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
EMBQ6PCB8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
EMBQ6PCB8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
EMBQ6PCB8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
EMBQ6PCB8 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
EMBQ6PCB8 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
EMBQ6PCB8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
EMBQ6PCB8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
EMBQ6PCB8 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
EMBQ6PCB8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
EMBQ6PCB8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EMBQ6PCB8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EMBQ6PCB8 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EMBQ6PCB8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
EMBQ6PCB8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EMBQ6PCB8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EMBQ6PCB8 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
EMBQ6PCB8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EMBQ6PCB8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EMBQ6PCB8 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EMBQ6PCB8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
EMBQ6PCB8 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
EMBQ6PCB8 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EMBQ6PCB8 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EMBQ6PCB8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
EMBQ6PCB8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
EMBQ6PCB8 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
EMBQ6PCB8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EMBQ6PCB8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
EMBQ6PCB8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EMBQ6PCB8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EMBQ6PCB8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EMBQ6PCB8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
EMBQ6PCB8 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
EMBQ6PCB8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EMBQ6PCB8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
EMBQ6PCB8 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EMBQ6PCB8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
EMBQ6PCB8 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
EMBQ6PCB8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EMBQ6PCB8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
EMBQ6PCB8 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EMBQ6PCB8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EMBQ6PCB8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EMBQ6PCB8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
EMBQ6PCB8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
EMBQ6PCB8 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
EMBQ6PCB8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EMBQ6PCB8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EMBQ6PCB8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
EMBQ6PCB8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EMBQ6PCB8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
EMBQ6PCB8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EMBQ6PCB8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EMBQ6PCB8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
EMBQ6PCB8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EMBQ6PCB8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
EMBQ6PCB8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EMBQ6PCB8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
EMBQ6PCB8 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EMBQ6PCB8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
EMBQ6PCB8 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EMBQ6PCB8 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EMBQ6PCB8 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
EMBQ6PCB8 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
EMBQ6PCB8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
EMBQ6PCB8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EMBQ6PCB8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EMBQ6PCB8 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
EMBQ6PCB8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
EMBQ6PCB8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
EMBQ6PCB8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
EMBQ6PCB8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
EMBQ6PCB8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
EMBQ6PCB8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
EMBQ6PCB8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EMBQ6PCB8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EMBQ6PCB8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EMBQ6PCB8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EMBQ6PCB8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
EMBQ6PCB8 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EMBQ6PCB8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EMBQ6PCB8 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
EMBQ6PCB8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
EMBQ6PCB8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
EMBQ6PCB8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
EMBQ6PCB8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
EMBQ6PCB8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms