Protein–RNA interactions for Protein: Q6IPU0

CENPP, Centromere protein P, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPPQ6IPU0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CENPPQ6IPU0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CENPPQ6IPU0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CENPPQ6IPU0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CENPPQ6IPU0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
CENPPQ6IPU0 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CENPPQ6IPU0 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CENPPQ6IPU0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CENPPQ6IPU0 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CENPPQ6IPU0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CENPPQ6IPU0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CENPPQ6IPU0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CENPPQ6IPU0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CENPPQ6IPU0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
CENPPQ6IPU0 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CENPPQ6IPU0 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.11■■■□□ 2.09
CENPPQ6IPU0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CENPPQ6IPU0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CENPPQ6IPU0 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CENPPQ6IPU0 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CENPPQ6IPU0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CENPPQ6IPU0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CENPPQ6IPU0 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CENPPQ6IPU0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CENPPQ6IPU0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CENPPQ6IPU0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CENPPQ6IPU0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CENPPQ6IPU0 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CENPPQ6IPU0 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CENPPQ6IPU0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CENPPQ6IPU0 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CENPPQ6IPU0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CENPPQ6IPU0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CENPPQ6IPU0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CENPPQ6IPU0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CENPPQ6IPU0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
CENPPQ6IPU0 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CENPPQ6IPU0 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CENPPQ6IPU0 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
CENPPQ6IPU0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CENPPQ6IPU0 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CENPPQ6IPU0 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CENPPQ6IPU0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CENPPQ6IPU0 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CENPPQ6IPU0 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CENPPQ6IPU0 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CENPPQ6IPU0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CENPPQ6IPU0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CENPPQ6IPU0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CENPPQ6IPU0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CENPPQ6IPU0 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CENPPQ6IPU0 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CENPPQ6IPU0 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CENPPQ6IPU0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
CENPPQ6IPU0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CENPPQ6IPU0 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CENPPQ6IPU0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CENPPQ6IPU0 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CENPPQ6IPU0 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CENPPQ6IPU0 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CENPPQ6IPU0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CENPPQ6IPU0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CENPPQ6IPU0 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CENPPQ6IPU0 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CENPPQ6IPU0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CENPPQ6IPU0 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CENPPQ6IPU0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CENPPQ6IPU0 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CENPPQ6IPU0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CENPPQ6IPU0 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CENPPQ6IPU0 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CENPPQ6IPU0 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CENPPQ6IPU0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CENPPQ6IPU0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CENPPQ6IPU0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CENPPQ6IPU0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CENPPQ6IPU0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CENPPQ6IPU0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CENPPQ6IPU0 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CENPPQ6IPU0 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CENPPQ6IPU0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CENPPQ6IPU0 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CENPPQ6IPU0 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CENPPQ6IPU0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CENPPQ6IPU0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CENPPQ6IPU0 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CENPPQ6IPU0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CENPPQ6IPU0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CENPPQ6IPU0 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CENPPQ6IPU0 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CENPPQ6IPU0 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CENPPQ6IPU0 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CENPPQ6IPU0 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CENPPQ6IPU0 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CENPPQ6IPU0 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CENPPQ6IPU0 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CENPPQ6IPU0 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CENPPQ6IPU0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CENPPQ6IPU0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CENPPQ6IPU0 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.6 ms