Protein–RNA interactions for Protein: Q5VW32

BROX, BRO1 domain-containing protein BROX, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BROXQ5VW32 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
BROXQ5VW32 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
BROXQ5VW32 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BROXQ5VW32 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
BROXQ5VW32 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
BROXQ5VW32 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BROXQ5VW32 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
BROXQ5VW32 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
BROXQ5VW32 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BROXQ5VW32 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BROXQ5VW32 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
BROXQ5VW32 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BROXQ5VW32 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BROXQ5VW32 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
BROXQ5VW32 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
BROXQ5VW32 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
BROXQ5VW32 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BROXQ5VW32 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
BROXQ5VW32 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
BROXQ5VW32 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BROXQ5VW32 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BROXQ5VW32 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
BROXQ5VW32 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
BROXQ5VW32 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
BROXQ5VW32 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
BROXQ5VW32 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
BROXQ5VW32 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BROXQ5VW32 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
BROXQ5VW32 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
BROXQ5VW32 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BROXQ5VW32 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
BROXQ5VW32 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
BROXQ5VW32 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
BROXQ5VW32 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
BROXQ5VW32 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BROXQ5VW32 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BROXQ5VW32 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
BROXQ5VW32 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
BROXQ5VW32 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BROXQ5VW32 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BROXQ5VW32 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
BROXQ5VW32 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BROXQ5VW32 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BROXQ5VW32 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
BROXQ5VW32 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
BROXQ5VW32 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BROXQ5VW32 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
BROXQ5VW32 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
BROXQ5VW32 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BROXQ5VW32 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
BROXQ5VW32 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
BROXQ5VW32 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BROXQ5VW32 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
BROXQ5VW32 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BROXQ5VW32 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BROXQ5VW32 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
BROXQ5VW32 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
BROXQ5VW32 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BROXQ5VW32 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
BROXQ5VW32 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
BROXQ5VW32 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BROXQ5VW32 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BROXQ5VW32 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
BROXQ5VW32 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BROXQ5VW32 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BROXQ5VW32 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BROXQ5VW32 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
BROXQ5VW32 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BROXQ5VW32 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
BROXQ5VW32 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BROXQ5VW32 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
BROXQ5VW32 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BROXQ5VW32 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BROXQ5VW32 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
BROXQ5VW32 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BROXQ5VW32 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
BROXQ5VW32 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
BROXQ5VW32 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BROXQ5VW32 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BROXQ5VW32 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BROXQ5VW32 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
BROXQ5VW32 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
BROXQ5VW32 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BROXQ5VW32 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BROXQ5VW32 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BROXQ5VW32 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BROXQ5VW32 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
BROXQ5VW32 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
BROXQ5VW32 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BROXQ5VW32 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BROXQ5VW32 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
BROXQ5VW32 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.5■■□□□ 1.51
BROXQ5VW32 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
BROXQ5VW32 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BROXQ5VW32 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
BROXQ5VW32 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
BROXQ5VW32 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
BROXQ5VW32 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BROXQ5VW32 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
BROXQ5VW32 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms