Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUR7

ANKRD20A3, Ankyrin repeat domain-containing protein 20A3, humanhuman

Predictions only

Length 823 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD20A3Q5VUR7 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ANKRD20A3Q5VUR7 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ANKRD20A3Q5VUR7 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ANKRD20A3Q5VUR7 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ANKRD20A3Q5VUR7 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
ANKRD20A3Q5VUR7 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
ANKRD20A3Q5VUR7 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
ANKRD20A3Q5VUR7 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ANKRD20A3Q5VUR7 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ANKRD20A3Q5VUR7 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ANKRD20A3Q5VUR7 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
ANKRD20A3Q5VUR7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
ANKRD20A3Q5VUR7 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ANKRD20A3Q5VUR7 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ANKRD20A3Q5VUR7 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
ANKRD20A3Q5VUR7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ANKRD20A3Q5VUR7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
ANKRD20A3Q5VUR7 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
ANKRD20A3Q5VUR7 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ANKRD20A3Q5VUR7 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ANKRD20A3Q5VUR7 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
ANKRD20A3Q5VUR7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ANKRD20A3Q5VUR7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
ANKRD20A3Q5VUR7 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ANKRD20A3Q5VUR7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
ANKRD20A3Q5VUR7 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
ANKRD20A3Q5VUR7 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
ANKRD20A3Q5VUR7 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
ANKRD20A3Q5VUR7 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ANKRD20A3Q5VUR7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ANKRD20A3Q5VUR7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
ANKRD20A3Q5VUR7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ANKRD20A3Q5VUR7 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
ANKRD20A3Q5VUR7 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ANKRD20A3Q5VUR7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
ANKRD20A3Q5VUR7 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ANKRD20A3Q5VUR7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
ANKRD20A3Q5VUR7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ANKRD20A3Q5VUR7 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ANKRD20A3Q5VUR7 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
ANKRD20A3Q5VUR7 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
ANKRD20A3Q5VUR7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
ANKRD20A3Q5VUR7 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ANKRD20A3Q5VUR7 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
ANKRD20A3Q5VUR7 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC26■■□□□ 1.75
ANKRD20A3Q5VUR7 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ANKRD20A3Q5VUR7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ANKRD20A3Q5VUR7 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ANKRD20A3Q5VUR7 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ANKRD20A3Q5VUR7 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ANKRD20A3Q5VUR7 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
ANKRD20A3Q5VUR7 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
ANKRD20A3Q5VUR7 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ANKRD20A3Q5VUR7 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
ANKRD20A3Q5VUR7 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
ANKRD20A3Q5VUR7 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
ANKRD20A3Q5VUR7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ANKRD20A3Q5VUR7 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
ANKRD20A3Q5VUR7 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ANKRD20A3Q5VUR7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
ANKRD20A3Q5VUR7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
ANKRD20A3Q5VUR7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
ANKRD20A3Q5VUR7 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
ANKRD20A3Q5VUR7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ANKRD20A3Q5VUR7 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ANKRD20A3Q5VUR7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ANKRD20A3Q5VUR7 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ANKRD20A3Q5VUR7 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ANKRD20A3Q5VUR7 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ANKRD20A3Q5VUR7 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ANKRD20A3Q5VUR7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ANKRD20A3Q5VUR7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ANKRD20A3Q5VUR7 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ANKRD20A3Q5VUR7 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ANKRD20A3Q5VUR7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ANKRD20A3Q5VUR7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ANKRD20A3Q5VUR7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ANKRD20A3Q5VUR7 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ANKRD20A3Q5VUR7 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ANKRD20A3Q5VUR7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ANKRD20A3Q5VUR7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ANKRD20A3Q5VUR7 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ANKRD20A3Q5VUR7 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ANKRD20A3Q5VUR7 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ANKRD20A3Q5VUR7 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ANKRD20A3Q5VUR7 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ANKRD20A3Q5VUR7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ANKRD20A3Q5VUR7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ANKRD20A3Q5VUR7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
ANKRD20A3Q5VUR7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ANKRD20A3Q5VUR7 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ANKRD20A3Q5VUR7 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ANKRD20A3Q5VUR7 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
ANKRD20A3Q5VUR7 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ANKRD20A3Q5VUR7 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ANKRD20A3Q5VUR7 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ANKRD20A3Q5VUR7 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ANKRD20A3Q5VUR7 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ANKRD20A3Q5VUR7 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ANKRD20A3Q5VUR7 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.8 ms