Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTM2

AGAP9, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP9Q5VTM2 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AGAP9Q5VTM2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
AGAP9Q5VTM2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
AGAP9Q5VTM2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
AGAP9Q5VTM2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
AGAP9Q5VTM2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AGAP9Q5VTM2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
AGAP9Q5VTM2 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AGAP9Q5VTM2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
AGAP9Q5VTM2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
AGAP9Q5VTM2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
AGAP9Q5VTM2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
AGAP9Q5VTM2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
AGAP9Q5VTM2 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
AGAP9Q5VTM2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
AGAP9Q5VTM2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AGAP9Q5VTM2 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AGAP9Q5VTM2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
AGAP9Q5VTM2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AGAP9Q5VTM2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
AGAP9Q5VTM2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AGAP9Q5VTM2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
AGAP9Q5VTM2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AGAP9Q5VTM2 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
AGAP9Q5VTM2 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
AGAP9Q5VTM2 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
AGAP9Q5VTM2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AGAP9Q5VTM2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AGAP9Q5VTM2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AGAP9Q5VTM2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AGAP9Q5VTM2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AGAP9Q5VTM2 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AGAP9Q5VTM2 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AGAP9Q5VTM2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AGAP9Q5VTM2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
AGAP9Q5VTM2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AGAP9Q5VTM2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AGAP9Q5VTM2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AGAP9Q5VTM2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
AGAP9Q5VTM2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AGAP9Q5VTM2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AGAP9Q5VTM2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AGAP9Q5VTM2 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AGAP9Q5VTM2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AGAP9Q5VTM2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AGAP9Q5VTM2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
AGAP9Q5VTM2 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
AGAP9Q5VTM2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AGAP9Q5VTM2 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AGAP9Q5VTM2 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AGAP9Q5VTM2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AGAP9Q5VTM2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AGAP9Q5VTM2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AGAP9Q5VTM2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AGAP9Q5VTM2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
AGAP9Q5VTM2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AGAP9Q5VTM2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AGAP9Q5VTM2 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AGAP9Q5VTM2 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AGAP9Q5VTM2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AGAP9Q5VTM2 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AGAP9Q5VTM2 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AGAP9Q5VTM2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AGAP9Q5VTM2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AGAP9Q5VTM2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
AGAP9Q5VTM2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AGAP9Q5VTM2 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AGAP9Q5VTM2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AGAP9Q5VTM2 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
AGAP9Q5VTM2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
AGAP9Q5VTM2 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
AGAP9Q5VTM2 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
AGAP9Q5VTM2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
AGAP9Q5VTM2 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
AGAP9Q5VTM2 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
AGAP9Q5VTM2 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
AGAP9Q5VTM2 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
AGAP9Q5VTM2 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
AGAP9Q5VTM2 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
AGAP9Q5VTM2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
AGAP9Q5VTM2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AGAP9Q5VTM2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
AGAP9Q5VTM2 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
AGAP9Q5VTM2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AGAP9Q5VTM2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AGAP9Q5VTM2 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AGAP9Q5VTM2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
AGAP9Q5VTM2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AGAP9Q5VTM2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
AGAP9Q5VTM2 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AGAP9Q5VTM2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AGAP9Q5VTM2 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AGAP9Q5VTM2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
AGAP9Q5VTM2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
AGAP9Q5VTM2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
AGAP9Q5VTM2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
AGAP9Q5VTM2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
AGAP9Q5VTM2 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AGAP9Q5VTM2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
AGAP9Q5VTM2 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.7 ms