Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2N8

ATAD3C, ATPase family AAA domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD3CQ5T2N8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATAD3CQ5T2N8 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATAD3CQ5T2N8 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATAD3CQ5T2N8 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATAD3CQ5T2N8 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATAD3CQ5T2N8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATAD3CQ5T2N8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATAD3CQ5T2N8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
ATAD3CQ5T2N8 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATAD3CQ5T2N8 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATAD3CQ5T2N8 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
ATAD3CQ5T2N8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATAD3CQ5T2N8 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATAD3CQ5T2N8 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATAD3CQ5T2N8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATAD3CQ5T2N8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
ATAD3CQ5T2N8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATAD3CQ5T2N8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATAD3CQ5T2N8 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATAD3CQ5T2N8 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATAD3CQ5T2N8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATAD3CQ5T2N8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
ATAD3CQ5T2N8 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
ATAD3CQ5T2N8 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATAD3CQ5T2N8 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATAD3CQ5T2N8 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATAD3CQ5T2N8 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
ATAD3CQ5T2N8 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATAD3CQ5T2N8 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATAD3CQ5T2N8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATAD3CQ5T2N8 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATAD3CQ5T2N8 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATAD3CQ5T2N8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
ATAD3CQ5T2N8 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATAD3CQ5T2N8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATAD3CQ5T2N8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATAD3CQ5T2N8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATAD3CQ5T2N8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
ATAD3CQ5T2N8 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATAD3CQ5T2N8 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
ATAD3CQ5T2N8 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATAD3CQ5T2N8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATAD3CQ5T2N8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
ATAD3CQ5T2N8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATAD3CQ5T2N8 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATAD3CQ5T2N8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATAD3CQ5T2N8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
ATAD3CQ5T2N8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATAD3CQ5T2N8 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATAD3CQ5T2N8 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATAD3CQ5T2N8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATAD3CQ5T2N8 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATAD3CQ5T2N8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATAD3CQ5T2N8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATAD3CQ5T2N8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATAD3CQ5T2N8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
ATAD3CQ5T2N8 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATAD3CQ5T2N8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATAD3CQ5T2N8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
ATAD3CQ5T2N8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATAD3CQ5T2N8 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
ATAD3CQ5T2N8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATAD3CQ5T2N8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
ATAD3CQ5T2N8 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATAD3CQ5T2N8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATAD3CQ5T2N8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATAD3CQ5T2N8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATAD3CQ5T2N8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
ATAD3CQ5T2N8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATAD3CQ5T2N8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATAD3CQ5T2N8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
ATAD3CQ5T2N8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATAD3CQ5T2N8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATAD3CQ5T2N8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATAD3CQ5T2N8 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
ATAD3CQ5T2N8 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATAD3CQ5T2N8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATAD3CQ5T2N8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATAD3CQ5T2N8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATAD3CQ5T2N8 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATAD3CQ5T2N8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATAD3CQ5T2N8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATAD3CQ5T2N8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
ATAD3CQ5T2N8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATAD3CQ5T2N8 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATAD3CQ5T2N8 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATAD3CQ5T2N8 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
ATAD3CQ5T2N8 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATAD3CQ5T2N8 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATAD3CQ5T2N8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
ATAD3CQ5T2N8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATAD3CQ5T2N8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
ATAD3CQ5T2N8 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATAD3CQ5T2N8 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATAD3CQ5T2N8 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATAD3CQ5T2N8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
ATAD3CQ5T2N8 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATAD3CQ5T2N8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
ATAD3CQ5T2N8 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
ATAD3CQ5T2N8 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.7 ms