Protein–RNA interactions for Protein: Q5J8M3

EMC4, ER membrane protein complex subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMC4Q5J8M3 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EMC4Q5J8M3 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EMC4Q5J8M3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EMC4Q5J8M3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
EMC4Q5J8M3 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EMC4Q5J8M3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EMC4Q5J8M3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
EMC4Q5J8M3 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EMC4Q5J8M3 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
EMC4Q5J8M3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EMC4Q5J8M3 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EMC4Q5J8M3 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
EMC4Q5J8M3 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
EMC4Q5J8M3 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
EMC4Q5J8M3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
EMC4Q5J8M3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EMC4Q5J8M3 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EMC4Q5J8M3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
EMC4Q5J8M3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EMC4Q5J8M3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
EMC4Q5J8M3 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EMC4Q5J8M3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EMC4Q5J8M3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
EMC4Q5J8M3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
EMC4Q5J8M3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
EMC4Q5J8M3 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
EMC4Q5J8M3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
EMC4Q5J8M3 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EMC4Q5J8M3 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
EMC4Q5J8M3 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EMC4Q5J8M3 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EMC4Q5J8M3 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EMC4Q5J8M3 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
EMC4Q5J8M3 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EMC4Q5J8M3 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EMC4Q5J8M3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EMC4Q5J8M3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EMC4Q5J8M3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EMC4Q5J8M3 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EMC4Q5J8M3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EMC4Q5J8M3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EMC4Q5J8M3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EMC4Q5J8M3 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EMC4Q5J8M3 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EMC4Q5J8M3 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EMC4Q5J8M3 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EMC4Q5J8M3 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EMC4Q5J8M3 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EMC4Q5J8M3 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EMC4Q5J8M3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EMC4Q5J8M3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EMC4Q5J8M3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EMC4Q5J8M3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EMC4Q5J8M3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EMC4Q5J8M3 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EMC4Q5J8M3 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EMC4Q5J8M3 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EMC4Q5J8M3 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EMC4Q5J8M3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EMC4Q5J8M3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EMC4Q5J8M3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
EMC4Q5J8M3 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EMC4Q5J8M3 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EMC4Q5J8M3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EMC4Q5J8M3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
EMC4Q5J8M3 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EMC4Q5J8M3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EMC4Q5J8M3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EMC4Q5J8M3 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EMC4Q5J8M3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
EMC4Q5J8M3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EMC4Q5J8M3 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EMC4Q5J8M3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
EMC4Q5J8M3 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
EMC4Q5J8M3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EMC4Q5J8M3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EMC4Q5J8M3 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EMC4Q5J8M3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EMC4Q5J8M3 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EMC4Q5J8M3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EMC4Q5J8M3 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
EMC4Q5J8M3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
EMC4Q5J8M3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EMC4Q5J8M3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
EMC4Q5J8M3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EMC4Q5J8M3 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EMC4Q5J8M3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EMC4Q5J8M3 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EMC4Q5J8M3 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EMC4Q5J8M3 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EMC4Q5J8M3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
EMC4Q5J8M3 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
EMC4Q5J8M3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
EMC4Q5J8M3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EMC4Q5J8M3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EMC4Q5J8M3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
EMC4Q5J8M3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EMC4Q5J8M3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
EMC4Q5J8M3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
EMC4Q5J8M3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms