Protein–RNA interactions for Protein: Q53GD3

SLC44A4, Choline transporter-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A4Q53GD3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC44A4Q53GD3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC44A4Q53GD3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC44A4Q53GD3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC44A4Q53GD3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC44A4Q53GD3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC44A4Q53GD3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC44A4Q53GD3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC44A4Q53GD3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC44A4Q53GD3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC44A4Q53GD3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC44A4Q53GD3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC44A4Q53GD3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC44A4Q53GD3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC44A4Q53GD3 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC44A4Q53GD3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC44A4Q53GD3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC44A4Q53GD3 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC44A4Q53GD3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC44A4Q53GD3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC44A4Q53GD3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC44A4Q53GD3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC44A4Q53GD3 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC44A4Q53GD3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC44A4Q53GD3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC44A4Q53GD3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC44A4Q53GD3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
SLC44A4Q53GD3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC44A4Q53GD3 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC44A4Q53GD3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC44A4Q53GD3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC44A4Q53GD3 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC44A4Q53GD3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC44A4Q53GD3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC44A4Q53GD3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC44A4Q53GD3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC44A4Q53GD3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC44A4Q53GD3 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC44A4Q53GD3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC44A4Q53GD3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC44A4Q53GD3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC44A4Q53GD3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC44A4Q53GD3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC44A4Q53GD3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC44A4Q53GD3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC44A4Q53GD3 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC44A4Q53GD3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC44A4Q53GD3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC44A4Q53GD3 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC44A4Q53GD3 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC44A4Q53GD3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC44A4Q53GD3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC44A4Q53GD3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC44A4Q53GD3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
SLC44A4Q53GD3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
SLC44A4Q53GD3 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC44A4Q53GD3 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC44A4Q53GD3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC44A4Q53GD3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC44A4Q53GD3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
SLC44A4Q53GD3 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
SLC44A4Q53GD3 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC44A4Q53GD3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
SLC44A4Q53GD3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC44A4Q53GD3 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC44A4Q53GD3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC44A4Q53GD3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
SLC44A4Q53GD3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC44A4Q53GD3 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC44A4Q53GD3 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC44A4Q53GD3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC44A4Q53GD3 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC44A4Q53GD3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC44A4Q53GD3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC44A4Q53GD3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
SLC44A4Q53GD3 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC44A4Q53GD3 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC44A4Q53GD3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
SLC44A4Q53GD3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC44A4Q53GD3 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC44A4Q53GD3 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
SLC44A4Q53GD3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC44A4Q53GD3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC44A4Q53GD3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC44A4Q53GD3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC44A4Q53GD3 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC44A4Q53GD3 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
SLC44A4Q53GD3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC44A4Q53GD3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC44A4Q53GD3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
SLC44A4Q53GD3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC44A4Q53GD3 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC44A4Q53GD3 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC44A4Q53GD3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC44A4Q53GD3 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC44A4Q53GD3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
SLC44A4Q53GD3 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
SLC44A4Q53GD3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
SLC44A4Q53GD3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
SLC44A4Q53GD3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms