Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
DUSP28Q4G0W2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.74■■■□□ 2.19
DUSP28Q4G0W2 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
DUSP28Q4G0W2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
DUSP28Q4G0W2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
DUSP28Q4G0W2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
DUSP28Q4G0W2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
DUSP28Q4G0W2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
DUSP28Q4G0W2 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
DUSP28Q4G0W2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
DUSP28Q4G0W2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
DUSP28Q4G0W2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
DUSP28Q4G0W2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
DUSP28Q4G0W2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
DUSP28Q4G0W2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
DUSP28Q4G0W2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
DUSP28Q4G0W2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
DUSP28Q4G0W2 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
DUSP28Q4G0W2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
DUSP28Q4G0W2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
DUSP28Q4G0W2 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
DUSP28Q4G0W2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
DUSP28Q4G0W2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
DUSP28Q4G0W2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
DUSP28Q4G0W2 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
DUSP28Q4G0W2 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
DUSP28Q4G0W2 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
DUSP28Q4G0W2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
DUSP28Q4G0W2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
DUSP28Q4G0W2 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
DUSP28Q4G0W2 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
DUSP28Q4G0W2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
DUSP28Q4G0W2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
DUSP28Q4G0W2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
DUSP28Q4G0W2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
DUSP28Q4G0W2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
DUSP28Q4G0W2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.65■■■□□ 2.18
DUSP28Q4G0W2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
DUSP28Q4G0W2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
DUSP28Q4G0W2 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
DUSP28Q4G0W2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.65■■■□□ 2.18
DUSP28Q4G0W2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
DUSP28Q4G0W2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
DUSP28Q4G0W2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
DUSP28Q4G0W2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
DUSP28Q4G0W2 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.63■■■□□ 2.17
DUSP28Q4G0W2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
DUSP28Q4G0W2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
DUSP28Q4G0W2 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
DUSP28Q4G0W2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
DUSP28Q4G0W2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
DUSP28Q4G0W2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
DUSP28Q4G0W2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
DUSP28Q4G0W2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
DUSP28Q4G0W2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
DUSP28Q4G0W2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
DUSP28Q4G0W2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
DUSP28Q4G0W2 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
DUSP28Q4G0W2 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
DUSP28Q4G0W2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
DUSP28Q4G0W2 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
DUSP28Q4G0W2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
DUSP28Q4G0W2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DUSP28Q4G0W2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DUSP28Q4G0W2 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
DUSP28Q4G0W2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
DUSP28Q4G0W2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DUSP28Q4G0W2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
DUSP28Q4G0W2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
DUSP28Q4G0W2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
DUSP28Q4G0W2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
DUSP28Q4G0W2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
DUSP28Q4G0W2 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
DUSP28Q4G0W2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.53■■■□□ 2.16
DUSP28Q4G0W2 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
DUSP28Q4G0W2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DUSP28Q4G0W2 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
DUSP28Q4G0W2 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
DUSP28Q4G0W2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
DUSP28Q4G0W2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
DUSP28Q4G0W2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
DUSP28Q4G0W2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DUSP28Q4G0W2 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
DUSP28Q4G0W2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
DUSP28Q4G0W2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
DUSP28Q4G0W2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
DUSP28Q4G0W2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DUSP28Q4G0W2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DUSP28Q4G0W2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
DUSP28Q4G0W2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
DUSP28Q4G0W2 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DUSP28Q4G0W2 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
DUSP28Q4G0W2 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DUSP28Q4G0W2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DUSP28Q4G0W2 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
DUSP28Q4G0W2 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
DUSP28Q4G0W2 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
DUSP28Q4G0W2 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
DUSP28Q4G0W2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
DUSP28Q4G0W2 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms