Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
NBPF8Q3BBV2 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
NBPF8Q3BBV2 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
NBPF8Q3BBV2 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC36.54■■■■□ 3.44
NBPF8Q3BBV2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
NBPF8Q3BBV2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
NBPF8Q3BBV2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC36.53■■■■□ 3.44
NBPF8Q3BBV2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
NBPF8Q3BBV2 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
NBPF8Q3BBV2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
NBPF8Q3BBV2 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
NBPF8Q3BBV2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC36.52■■■■□ 3.44
NBPF8Q3BBV2 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
NBPF8Q3BBV2 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.51■■■■□ 3.44
NBPF8Q3BBV2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
NBPF8Q3BBV2 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
NBPF8Q3BBV2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
NBPF8Q3BBV2 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
NBPF8Q3BBV2 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
NBPF8Q3BBV2 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
NBPF8Q3BBV2 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
NBPF8Q3BBV2 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
NBPF8Q3BBV2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC36.46■■■■□ 3.43
NBPF8Q3BBV2 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
NBPF8Q3BBV2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC36.45■■■■□ 3.43
NBPF8Q3BBV2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
NBPF8Q3BBV2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC36.44■■■■□ 3.42
NBPF8Q3BBV2 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
NBPF8Q3BBV2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
NBPF8Q3BBV2 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
NBPF8Q3BBV2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
NBPF8Q3BBV2 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
NBPF8Q3BBV2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
NBPF8Q3BBV2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
NBPF8Q3BBV2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
NBPF8Q3BBV2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
NBPF8Q3BBV2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
NBPF8Q3BBV2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
NBPF8Q3BBV2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
NBPF8Q3BBV2 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
NBPF8Q3BBV2 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
NBPF8Q3BBV2 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.37■■■■□ 3.41
NBPF8Q3BBV2 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
NBPF8Q3BBV2 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC36.35■■■■□ 3.41
NBPF8Q3BBV2 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
NBPF8Q3BBV2 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
NBPF8Q3BBV2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
NBPF8Q3BBV2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
NBPF8Q3BBV2 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
NBPF8Q3BBV2 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
NBPF8Q3BBV2 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC36.32■■■■□ 3.41
NBPF8Q3BBV2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
NBPF8Q3BBV2 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
NBPF8Q3BBV2 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
NBPF8Q3BBV2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.31■■■■□ 3.4
NBPF8Q3BBV2 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
NBPF8Q3BBV2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
NBPF8Q3BBV2 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
NBPF8Q3BBV2 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
NBPF8Q3BBV2 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC36.3■■■■□ 3.4
NBPF8Q3BBV2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
NBPF8Q3BBV2 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.29■■■■□ 3.4
NBPF8Q3BBV2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC36.28■■■■□ 3.4
NBPF8Q3BBV2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
NBPF8Q3BBV2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC36.28■■■■□ 3.4
NBPF8Q3BBV2 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
NBPF8Q3BBV2 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
NBPF8Q3BBV2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
NBPF8Q3BBV2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.4
NBPF8Q3BBV2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.4
NBPF8Q3BBV2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.4
NBPF8Q3BBV2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC36.26■■■■□ 3.4
NBPF8Q3BBV2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.26■■■■□ 3.4
NBPF8Q3BBV2 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.26■■■■□ 3.39
NBPF8Q3BBV2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC36.25■■■■□ 3.39
NBPF8Q3BBV2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
NBPF8Q3BBV2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
NBPF8Q3BBV2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.24■■■■□ 3.39
NBPF8Q3BBV2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
NBPF8Q3BBV2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
NBPF8Q3BBV2 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
NBPF8Q3BBV2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
NBPF8Q3BBV2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
NBPF8Q3BBV2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.22■■■■□ 3.39
NBPF8Q3BBV2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
NBPF8Q3BBV2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.21■■■■□ 3.39
NBPF8Q3BBV2 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC36.21■■■■□ 3.39
NBPF8Q3BBV2 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC36.21■■■■□ 3.39
NBPF8Q3BBV2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
NBPF8Q3BBV2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
NBPF8Q3BBV2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
NBPF8Q3BBV2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.2■■■■□ 3.39
NBPF8Q3BBV2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
NBPF8Q3BBV2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC36.19■■■■□ 3.38
NBPF8Q3BBV2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
NBPF8Q3BBV2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
NBPF8Q3BBV2 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC36.18■■■■□ 3.38
NBPF8Q3BBV2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
NBPF8Q3BBV2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
NBPF8Q3BBV2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC36.16■■■■□ 3.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms