Protein–RNA interactions for Protein: Q16620

NTRK2, BDNF/NT-3 growth factors receptor, humanhuman

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Length 822 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NTRK2Q16620 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NTRK2Q16620 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NTRK2Q16620 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
NTRK2Q16620 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
NTRK2Q16620 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NTRK2Q16620 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
NTRK2Q16620 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NTRK2Q16620 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
NTRK2Q16620 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NTRK2Q16620 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
NTRK2Q16620 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NTRK2Q16620 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NTRK2Q16620 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
NTRK2Q16620 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NTRK2Q16620 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NTRK2Q16620 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
NTRK2Q16620 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NTRK2Q16620 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
NTRK2Q16620 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
NTRK2Q16620 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NTRK2Q16620 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NTRK2Q16620 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
NTRK2Q16620 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
NTRK2Q16620 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
NTRK2Q16620 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NTRK2Q16620 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
NTRK2Q16620 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
NTRK2Q16620 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
NTRK2Q16620 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NTRK2Q16620 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NTRK2Q16620 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
NTRK2Q16620 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NTRK2Q16620 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NTRK2Q16620 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
NTRK2Q16620 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NTRK2Q16620 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
NTRK2Q16620 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NTRK2Q16620 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NTRK2Q16620 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NTRK2Q16620 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NTRK2Q16620 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NTRK2Q16620 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NTRK2Q16620 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NTRK2Q16620 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NTRK2Q16620 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NTRK2Q16620 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NTRK2Q16620 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NTRK2Q16620 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NTRK2Q16620 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NTRK2Q16620 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NTRK2Q16620 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NTRK2Q16620 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NTRK2Q16620 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NTRK2Q16620 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NTRK2Q16620 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NTRK2Q16620 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
NTRK2Q16620 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NTRK2Q16620 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NTRK2Q16620 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NTRK2Q16620 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NTRK2Q16620 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NTRK2Q16620 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NTRK2Q16620 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NTRK2Q16620 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NTRK2Q16620 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NTRK2Q16620 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
NTRK2Q16620 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NTRK2Q16620 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NTRK2Q16620 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NTRK2Q16620 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NTRK2Q16620 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
NTRK2Q16620 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NTRK2Q16620 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NTRK2Q16620 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NTRK2Q16620 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NTRK2Q16620 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NTRK2Q16620 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NTRK2Q16620 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NTRK2Q16620 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NTRK2Q16620 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NTRK2Q16620 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NTRK2Q16620 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
NTRK2Q16620 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NTRK2Q16620 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
NTRK2Q16620 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NTRK2Q16620 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NTRK2Q16620 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NTRK2Q16620 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NTRK2Q16620 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NTRK2Q16620 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NTRK2Q16620 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NTRK2Q16620 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NTRK2Q16620 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NTRK2Q16620 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
NTRK2Q16620 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NTRK2Q16620 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NTRK2Q16620 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NTRK2Q16620 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NTRK2Q16620 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NTRK2Q16620 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
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