Protein–RNA interactions for Protein: Q14978

NOLC1, Nucleolar and coiled-body phosphoprotein 1, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOLC1Q14978 DHRS11-209ENST00000610443 4505 nt14.04□□□□□ -0.164e-9■■■■■ 32.5
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NOLC1Q14978 DHRS11-216ENST00000621871 883 ntTSL 37.6□□□□□ -1.194e-9■■■■■ 32.5
NOLC1Q14978 PSMD14-205ENST00000492908 1786 ntTSL 25.11□□□□□ -1.594e-9■■■■■ 32.5
NOLC1Q14978 PSMD14-203ENST00000477232 4890 ntTSL 1 (best)2.47□□□□□ -2.014e-9■■■■■ 32.5
NOLC1Q14978 MIR3651-201ENST00000630427 90 ntBASIC3.54□□□□□ -1.841e-323■■■■■ 32.5
NOLC1Q14978 EIF4A2-223ENST00000494445 629 ntTSL 29.77□□□□□ -0.858e-9■■■■■ 32.4
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NOLC1Q14978 SNHG1-206ENST00000537925 1487 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.342e-19■■■■■ 32.2
NOLC1Q14978 SNHG1-209ENST00000538654 2768 ntTSL 210.94□□□□□ -0.662e-19■■■■■ 32.2
NOLC1Q14978 SNHG1-204ENST00000537068 629 ntTSL 5 BASIC5.7□□□□□ -1.52e-19■■■■■ 32.2
NOLC1Q14978 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC5.12□□□□□ -1.592e-19■■■■■ 32.2
NOLC1Q14978 GAS5-225ENST00000454813 621 ntTSL 36.7□□□□□ -1.341e-323■■■■■ 32.2
NOLC1Q14978 DDX39B-206ENST00000419338 928 ntTSL 515.29■□□□□ 0.041e-323■■■■■ 32.2
NOLC1Q14978 ATP6V1G2-DDX39B-201ENST00000376185 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.38□□□□□ -0.111e-9■■■■■ 32.2
NOLC1Q14978 DDX39B-214ENST00000458640 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.211e-9■■■■■ 32.2
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NOLC1Q14978 DDX39B-210ENST00000431908 914 ntTSL 512.95□□□□□ -0.341e-323■■■■■ 32.2
NOLC1Q14978 DDX39B-208ENST00000428098 817 ntTSL 312.83□□□□□ -0.361e-323■■■■■ 32.2
NOLC1Q14978 DDX39B-212ENST00000456662 932 ntTSL 512.83□□□□□ -0.361e-323■■■■■ 32.2
NOLC1Q14978 DDX39B-220ENST00000482195 1232 ntTSL 211.25□□□□□ -0.611e-323■■■■■ 32.2
NOLC1Q14978 DDX39B-202ENST00000396172 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.8□□□□□ -0.681e-9■■■■■ 32.2
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NOLC1Q14978 GAS5-207ENST00000422207 643 ntTSL 26.09□□□□□ -1.431e-323■■■■■ 32.1
NOLC1Q14978 GAS5-212ENST00000434796 575 ntTSL 23.52□□□□□ -1.851e-323■■■■■ 32.1
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NOLC1Q14978 VDAC2-202ENST00000313132 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.079e-11■■■■■ 31.9
NOLC1Q14978 VDAC2-207ENST00000460044 770 ntTSL 211.66□□□□□ -0.549e-11■■■■■ 31.9
NOLC1Q14978 VDAC2-214ENST00000543351 1424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.229e-11■■■■■ 31.9
NOLC1Q14978 PSMA5-204ENST00000490870 1667 ntTSL 1 (best)11.18□□□□□ -0.624e-9■■■■■ 31.8
NOLC1Q14978 PSMA5-201ENST00000271308 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.34□□□□□ -1.714e-9■■■■■ 31.8
NOLC1Q14978 DKC1-212ENST00000492372 406 ntTSL 29.47□□□□□ -0.891e-323■■■■■ 31.6
NOLC1Q14978 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.314e-7■■■■■ 31.6
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NOLC1Q14978 COX19-202ENST00000457254 1420 ntTSL 218.37■□□□□ 0.534e-7■■■■■ 31.6
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NOLC1Q14978 CTNNB1-201ENST00000349496 3737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.045e-10■■■■■ 31.5
NOLC1Q14978 CTNNB1-203ENST00000396185 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.46□□□□□ -0.15e-10■■■■■ 31.5
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NOLC1Q14978 SNORA62-201ENST00000365493 153 ntBASIC4.95□□□□□ -1.622e-88■■■■■ 31
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NOLC1Q14978 RPS27A-202ENST00000402285 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.42□□□□□ -0.585e-18■■■■■ 31
NOLC1Q14978 RPS27A-203ENST00000404735 796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.65e-18■■■■■ 31
NOLC1Q14978 RPS27A-210ENST00000495843 1159 ntTSL 59.85□□□□□ -0.835e-18■■■■■ 31
NOLC1Q14978 RPL13A-206ENST00000476268 1623 ntTSL 319.96■□□□□ 0.791e-323■■■■■ 31
NOLC1Q14978 RPL13A-208ENST00000477613 796 ntTSL 519.2■□□□□ 0.661e-323■■■■■ 31
NOLC1Q14978 RPL13A-209ENST00000479992 850 ntTSL 317.5■□□□□ 0.391e-323■■■■■ 31
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NOLC1Q14978 RPL13A-214ENST00000624069 1122 ntTSL 1 (best)16.41■□□□□ 0.221e-323■■■■■ 31
NOLC1Q14978 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.081e-323■■■■■ 31
NOLC1Q14978 RPL13A-210ENST00000484279 794 ntTSL 515.09■□□□□ 0.011e-323■■■■■ 31
NOLC1Q14978 RPL13A-213ENST00000621674 1098 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.011e-323■■■■■ 31
NOLC1Q14978 HIST1H2AC-201ENST00000314088 1668 ntTSL 1 (best)20.1■□□□□ 0.813e-12■■■■■ 30.8
NOLC1Q14978 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.463e-12■■■■■ 30.8
NOLC1Q14978 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.333e-12■■■■■ 30.8
NOLC1Q14978 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.322e-6■■■■■ 30.6
NOLC1Q14978 HNF4A-203ENST00000372920 3340 ntTSL 1 (best)21.72■■□□□ 1.072e-6■■■■■ 30.6
NOLC1Q14978 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.732e-6■■■■■ 30.6
NOLC1Q14978 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.282e-6■■■■■ 30.6
NOLC1Q14978 HNF4A-204ENST00000415691 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.132e-6■■■■■ 30.6
NOLC1Q14978 HNF4A-206ENST00000457232 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.182e-6■■■■■ 30.6
NOLC1Q14978 HNF4A-209ENST00000619550 4763 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.332e-6■■■■■ 30.6
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