RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000582965.1

SNHG25-202, Transcript of small nucleolar RNA host gene 25, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SNHG25, Length 278 nt, Biotype lincRNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG25-202ENST00000582965 NISCHQ9Y2I1 1504 aa33.8■■■■□ 3
SNHG25-202ENST00000582965 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa29.99■■■□□ 2.39
SNHG25-202ENST00000582965 ABCC9O60706 1549 aa29.2■■■□□ 2.26
SNHG25-202ENST00000582965 DCAF8L2P0C7V8 631 aa28.37■■■□□ 2.13
SNHG25-202ENST00000582965 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP28.17■■■□□ 2.1
SNHG25-202ENST00000582965 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa28.15■■■□□ 2.1
SNHG25-202ENST00000582965 NACADO15069 1562 aa28.14■■■□□ 2.1
SNHG25-202ENST00000582965 MYO15BQ96JP2 1530 aa27.94■■■□□ 2.06
SNHG25-202ENST00000582965 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa27.92■■■□□ 2.06
SNHG25-202ENST00000582965 UNC13AQ9UPW8 1703 aa27.58■■■□□ 2.01
SNHG25-202ENST00000582965 SCRIBQ14160 1630 aa27.45■■□□□ 1.98
SNHG25-202ENST00000582965 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP27.34■■□□□ 1.974e-9■□□□□ 8.7
SNHG25-202ENST00000582965 BICRAQ9NZM4 1560 aa27.23■■□□□ 1.95
SNHG25-202ENST00000582965 DNAJC5BQ9UF47 199 aa27.03■■□□□ 1.92
SNHG25-202ENST00000582965 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa26.96■■□□□ 1.91
SNHG25-202ENST00000582965 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP26.53■■□□□ 1.84
SNHG25-202ENST00000582965 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa26.4■■□□□ 1.82
SNHG25-202ENST00000582965 CECR2Q9BXF3 1484 aa26.32■■□□□ 1.8
SNHG25-202ENST00000582965 SMARCA4P51532 1647 aa26.21■■□□□ 1.79
SNHG25-202ENST00000582965 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP26.2■■□□□ 1.79
SNHG25-202ENST00000582965 MROH2BQ7Z745 1585 aa26.07■■□□□ 1.76
SNHG25-202ENST00000582965 SMARCA2P51531 1590 aa26■■□□□ 1.75
SNHG25-202ENST00000582965 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa25.99■■□□□ 1.75
SNHG25-202ENST00000582965 NCAPD3P42695 1498 aa25.91■■□□□ 1.74
SNHG25-202ENST00000582965 PEG3Q9GZU2 1588 aa25.89■■□□□ 1.73
SNHG25-202ENST00000582965 WIZO95785 1651 aa25.87■■□□□ 1.73
SNHG25-202ENST00000582965 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP25.84■■□□□ 1.73
SNHG25-202ENST00000582965 HMGXB3Q12766 1538 aa25.83■■□□□ 1.72
SNHG25-202ENST00000582965 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP25.82■■□□□ 1.72
SNHG25-202ENST00000582965 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP25.53■■□□□ 1.68
SNHG25-202ENST00000582965 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP25.49■■□□□ 1.67
SNHG25-202ENST00000582965 NESP48681 1621 aa25.3■■□□□ 1.64
SNHG25-202ENST00000582965 CCDC88BA6NC98 1476 aa25.26■■□□□ 1.63
SNHG25-202ENST00000582965 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa25.26■■□□□ 1.63
SNHG25-202ENST00000582965 CADPSQ9ULU8 1353 aa25.21■■□□□ 1.63
SNHG25-202ENST00000582965 ERCC6Q03468 1493 aa25.18■■□□□ 1.62
SNHG25-202ENST00000582965 PDS5BQ9NTI5 1447 aa25.09■■□□□ 1.61
SNHG25-202ENST00000582965 CFTRP13569 1480 aa25.08■■□□□ 1.6
SNHG25-202ENST00000582965 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa25.07■■□□□ 1.6
SNHG25-202ENST00000582965 PRDM2Q13029 1718 aa25.03■■□□□ 1.6
SNHG25-202ENST00000582965 CUX2O14529 1486 aa25.01■■□□□ 1.59
SNHG25-202ENST00000582965 FANCD2Q9BXW9 1451 aa24.95■■□□□ 1.58
SNHG25-202ENST00000582965 CEP164Q9UPV0 1460 aa24.9■■□□□ 1.58
SNHG25-202ENST00000582965 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP24.84■■□□□ 1.57
SNHG25-202ENST00000582965 MRC2Q9UBG0 1479 aa24.81■■□□□ 1.56
SNHG25-202ENST00000582965 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa24.78■■□□□ 1.56
SNHG25-202ENST00000582965 WDR62O43379 1518 aa24.69■■□□□ 1.54
SNHG25-202ENST00000582965 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP24.66■■□□□ 1.54
SNHG25-202ENST00000582965 ABCC8Q09428 1581 aa24.58■■□□□ 1.52
SNHG25-202ENST00000582965 TOPBP1Q92547 1522 aa24.56■■□□□ 1.52
SNHG25-202ENST00000582965 DNMBPQ6XZF7 1577 aa24.55■■□□□ 1.52
SNHG25-202ENST00000582965 CUX1P39880 1505 aa24.45■■□□□ 1.5
SNHG25-202ENST00000582965 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP24.38■■□□□ 1.49
SNHG25-202ENST00000582965 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP24.36■■□□□ 1.49
SNHG25-202ENST00000582965 FGD5Q6ZNL6 1462 aa24.35■■□□□ 1.49
SNHG25-202ENST00000582965 IFT140Q96RY7 1462 aa24.35■■□□□ 1.49
SNHG25-202ENST00000582965 SYNJ1O43426 1573 aa24.31■■□□□ 1.48
SNHG25-202ENST00000582965 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa24.31■■□□□ 1.48
SNHG25-202ENST00000582965 SOGA1O94964 1423 aa24.3■■□□□ 1.48
SNHG25-202ENST00000582965 TOP2BQ02880 1626 aa24.3■■□□□ 1.48
SNHG25-202ENST00000582965 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa24.29■■□□□ 1.48
SNHG25-202ENST00000582965 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP24.27■■□□□ 1.48
SNHG25-202ENST00000582965 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP24.23■■□□□ 1.47
SNHG25-202ENST00000582965 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP24.16■■□□□ 1.46
SNHG25-202ENST00000582965 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP24.15■■□□□ 1.46
SNHG25-202ENST00000582965 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP24.14■■□□□ 1.463e-48■■■■■ 36.4
SNHG25-202ENST00000582965 WDR97A6NE52 1622 aa24.13■■□□□ 1.45
SNHG25-202ENST00000582965 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa24.09■■□□□ 1.45
SNHG25-202ENST00000582965 TRIM41Q8WV44 630 aa24.04■■□□□ 1.44
SNHG25-202ENST00000582965 GAPVD1Q14C86 1478 aa24.01■■□□□ 1.43
SNHG25-202ENST00000582965 PBRM1Q86U86 1689 aa24.01■■□□□ 1.43
SNHG25-202ENST00000582965 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa23.99■■□□□ 1.43
SNHG25-202ENST00000582965 GRIN2BQ13224 1484 aa23.97■■□□□ 1.43
SNHG25-202ENST00000582965 FBLN2P98095 1184 aa23.93■■□□□ 1.42
SNHG25-202ENST00000582965 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa23.92■■□□□ 1.42
SNHG25-202ENST00000582965 CHD1O14646 1710 aa23.89■■□□□ 1.41
SNHG25-202ENST00000582965 KIF27Q86VH2 1401 aa23.87■■□□□ 1.41
SNHG25-202ENST00000582965 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP23.87■■□□□ 1.41
SNHG25-202ENST00000582965 OSCARQ8IYS5 282 aa23.84■■□□□ 1.41
SNHG25-202ENST00000582965 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.84■■□□□ 1.41
SNHG25-202ENST00000582965 CHIC1Q5VXU3 224 aa23.82■■□□□ 1.4
SNHG25-202ENST00000582965 ERICH3Q5RHP9 1530 aa23.82■■□□□ 1.4
SNHG25-202ENST00000582965 SYNJ2O15056 1496 aa23.78■■□□□ 1.4
SNHG25-202ENST00000582965 ADAMTS12P58397 1594 aa23.75■■□□□ 1.39
SNHG25-202ENST00000582965 FHAD1B1AJZ9 1412 aa23.73■■□□□ 1.39
SNHG25-202ENST00000582965 IGF1RP08069 1367 aa23.72■■□□□ 1.39
SNHG25-202ENST00000582965 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa23.72■■□□□ 1.39
SNHG25-202ENST00000582965 CUL7Q14999 1698 aa23.68■■□□□ 1.38
SNHG25-202ENST00000582965 GRIN2AQ12879 1464 aa23.66■■□□□ 1.38
SNHG25-202ENST00000582965 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa23.62■■□□□ 1.37
SNHG25-202ENST00000582965 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP23.58■■□□□ 1.37
SNHG25-202ENST00000582965 CEP170Q5SW79 1584 aa23.53■■□□□ 1.36
SNHG25-202ENST00000582965 EEA1Q15075 1411 aa23.52■■□□□ 1.36
SNHG25-202ENST00000582965 CSRNP3Q8WYN3 585 aa23.52■■□□□ 1.36
SNHG25-202ENST00000582965 CLASP1Q7Z460 1538 aa23.52■■□□□ 1.36
SNHG25-202ENST00000582965 NUP160Q12769 1436 aa23.5■■□□□ 1.35
SNHG25-202ENST00000582965 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa23.49■■□□□ 1.35
SNHG25-202ENST00000582965 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa23.47■■□□□ 1.35
SNHG25-202ENST00000582965 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa23.47■■□□□ 1.35
SNHG25-202ENST00000582965 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa23.47■■□□□ 1.35
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