RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000580828.1

SNHG25-201, Transcript of small nucleolar RNA host gene 25, humanhuman

TSL 2

Gene SNHG25, Length 106 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG25-201ENST00000580828 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.84■■■□□ 2.37
SNHG25-201ENST00000580828 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa26.59■■□□□ 1.85
SNHG25-201ENST00000580828 ABCC9O60706 1549 aa26.28■■□□□ 1.8
SNHG25-201ENST00000580828 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa25.19■■□□□ 1.62
SNHG25-201ENST00000580828 NACADO15069 1562 aa25.12■■□□□ 1.61
SNHG25-201ENST00000580828 DCAF8L2P0C7V8 631 aa25.08■■□□□ 1.61
SNHG25-201ENST00000580828 MYO15BQ96JP2 1530 aa24.91■■□□□ 1.58
SNHG25-201ENST00000580828 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.78■■□□□ 1.56
SNHG25-201ENST00000580828 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa24.7■■□□□ 1.54
SNHG25-201ENST00000580828 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP24.55■■□□□ 1.524e-9■□□□□ 8.7
SNHG25-201ENST00000580828 UNC13AQ9UPW8 1703 aa24.51■■□□□ 1.51
SNHG25-201ENST00000580828 BICRAQ9NZM4 1560 aa24.4■■□□□ 1.5
SNHG25-201ENST00000580828 DNAJC5BQ9UF47 199 aa24.39■■□□□ 1.49
SNHG25-201ENST00000580828 SCRIBQ14160 1630 aa24.22■■□□□ 1.47
SNHG25-201ENST00000580828 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa24.19■■□□□ 1.46
SNHG25-201ENST00000580828 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP23.79■■□□□ 1.4
SNHG25-201ENST00000580828 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa23.74■■□□□ 1.39
SNHG25-201ENST00000580828 CECR2Q9BXF3 1484 aa23.67■■□□□ 1.38
SNHG25-201ENST00000580828 NCAPD3P42695 1498 aa23.21■■□□□ 1.31
SNHG25-201ENST00000580828 SMARCA4P51532 1647 aa23.17■■□□□ 1.3
SNHG25-201ENST00000580828 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa23.15■■□□□ 1.3
SNHG25-201ENST00000580828 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.3
SNHG25-201ENST00000580828 SMARCA2P51531 1590 aa23.11■■□□□ 1.29
SNHG25-201ENST00000580828 HMGXB3Q12766 1538 aa23.03■■□□□ 1.28
SNHG25-201ENST00000580828 PEG3Q9GZU2 1588 aa22.97■■□□□ 1.27
SNHG25-201ENST00000580828 MROH2BQ7Z745 1585 aa22.97■■□□□ 1.27
SNHG25-201ENST00000580828 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP22.94■■□□□ 1.26
SNHG25-201ENST00000580828 ERCC6Q03468 1493 aa22.7■■□□□ 1.22
SNHG25-201ENST00000580828 WIZO95785 1651 aa22.67■■□□□ 1.22
SNHG25-201ENST00000580828 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP22.65■■□□□ 1.22
SNHG25-201ENST00000580828 NESP48681 1621 aa22.65■■□□□ 1.22
SNHG25-201ENST00000580828 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa22.59■■□□□ 1.21
SNHG25-201ENST00000580828 CUX2O14529 1486 aa22.56■■□□□ 1.2
SNHG25-201ENST00000580828 CADPSQ9ULU8 1353 aa22.52■■□□□ 1.2
SNHG25-201ENST00000580828 PDS5BQ9NTI5 1447 aa22.5■■□□□ 1.19
SNHG25-201ENST00000580828 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP22.45■■□□□ 1.18
SNHG25-201ENST00000580828 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP22.33■■□□□ 1.17
SNHG25-201ENST00000580828 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa22.33■■□□□ 1.17
SNHG25-201ENST00000580828 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa22.33■■□□□ 1.16
SNHG25-201ENST00000580828 CFTRP13569 1480 aa22.31■■□□□ 1.16
SNHG25-201ENST00000580828 MRC2Q9UBG0 1479 aa22.23■■□□□ 1.15
SNHG25-201ENST00000580828 FANCD2Q9BXW9 1451 aa22.22■■□□□ 1.15
SNHG25-201ENST00000580828 CCDC88BA6NC98 1476 aa22.22■■□□□ 1.15
SNHG25-201ENST00000580828 CEP164Q9UPV0 1460 aa22.22■■□□□ 1.15
SNHG25-201ENST00000580828 WDR62O43379 1518 aa22.15■■□□□ 1.14
SNHG25-201ENST00000580828 PRDM2Q13029 1718 aa22.01■■□□□ 1.11
SNHG25-201ENST00000580828 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP22■■□□□ 1.11
SNHG25-201ENST00000580828 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP21.9■■□□□ 1.1
SNHG25-201ENST00000580828 ABCC8Q09428 1581 aa21.87■■□□□ 1.09
SNHG25-201ENST00000580828 TOPBP1Q92547 1522 aa21.83■■□□□ 1.09
SNHG25-201ENST00000580828 IFT140Q96RY7 1462 aa21.78■■□□□ 1.08
SNHG25-201ENST00000580828 DNMBPQ6XZF7 1577 aa21.78■■□□□ 1.08
SNHG25-201ENST00000580828 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP21.66■■□□□ 1.06
SNHG25-201ENST00000580828 OSCARQ8IYS5 282 aa21.64■■□□□ 1.05
SNHG25-201ENST00000580828 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP21.63■■□□□ 1.05
SNHG25-201ENST00000580828 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP21.59■■□□□ 1.05
SNHG25-201ENST00000580828 SOGA1O94964 1423 aa21.58■■□□□ 1.05
SNHG25-201ENST00000580828 CUX1P39880 1505 aa21.55■■□□□ 1.04
SNHG25-201ENST00000580828 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP21.54■■□□□ 1.043e-48■■■■■ 36.4
SNHG25-201ENST00000580828 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP21.53■■□□□ 1.04
SNHG25-201ENST00000580828 FGD5Q6ZNL6 1462 aa21.53■■□□□ 1.04
SNHG25-201ENST00000580828 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa21.53■■□□□ 1.04
SNHG25-201ENST00000580828 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP21.47■■□□□ 1.03
SNHG25-201ENST00000580828 WDR97A6NE52 1622 aa21.44■■□□□ 1.02
SNHG25-201ENST00000580828 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP21.37■■□□□ 1.01
SNHG25-201ENST00000580828 FBLN2P98095 1184 aa21.36■■□□□ 1.01
SNHG25-201ENST00000580828 GRIN2BQ13224 1484 aa21.34■■□□□ 1.01
SNHG25-201ENST00000580828 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa21.34■■□□□ 1.01
SNHG25-201ENST00000580828 TRIM41Q8WV44 630 aa21.32■■□□□ 1
SNHG25-201ENST00000580828 TOP2BQ02880 1626 aa21.31■■□□□ 1
SNHG25-201ENST00000580828 GAPVD1Q14C86 1478 aa21.31■■□□□ 1
SNHG25-201ENST00000580828 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa21.31■■□□□ 1
SNHG25-201ENST00000580828 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP21.31■■□□□ 1
SNHG25-201ENST00000580828 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP21.29■■□□□ 1
SNHG25-201ENST00000580828 CHD1O14646 1710 aa21.29■■□□□ 1
SNHG25-201ENST00000580828 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa21.29■■□□□ 1
SNHG25-201ENST00000580828 SYNJ1O43426 1573 aa21.26■□□□□ 0.99
SNHG25-201ENST00000580828 SYNJ2O15056 1496 aa21.22■□□□□ 0.99
SNHG25-201ENST00000580828 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa21.22■□□□□ 0.99
SNHG25-201ENST00000580828 ARHGEF11O15085 1522 aa21.2■□□□□ 0.98
SNHG25-201ENST00000580828 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa21.2■□□□□ 0.98
SNHG25-201ENST00000580828 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa21.2■□□□□ 0.98
SNHG25-201ENST00000580828 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa21.2■□□□□ 0.98
SNHG25-201ENST00000580828 PBRM1Q86U86 1689 aa21.18■□□□□ 0.98
SNHG25-201ENST00000580828 CLASP1Q7Z460 1538 aa21.1■□□□□ 0.97
SNHG25-201ENST00000580828 CYB5RLQ6IPT4 315 aa21.08■□□□□ 0.97
SNHG25-201ENST00000580828 ERICH3Q5RHP9 1530 aa21.08■□□□□ 0.96
SNHG25-201ENST00000580828 FHAD1B1AJZ9 1412 aa21.06■□□□□ 0.96
SNHG25-201ENST00000580828 GRIN2AQ12879 1464 aa21.05■□□□□ 0.96
SNHG25-201ENST00000580828 ADAMTS12P58397 1594 aa21.03■□□□□ 0.96
SNHG25-201ENST00000580828 ARAP1Q96P48 1450 aa21.01■□□□□ 0.95
SNHG25-201ENST00000580828 NUP160Q12769 1436 aa20.97■□□□□ 0.95
SNHG25-201ENST00000580828 KIF27Q86VH2 1401 aa20.96■□□□□ 0.95
SNHG25-201ENST00000580828 IGF1RP08069 1367 aa20.92■□□□□ 0.94
SNHG25-201ENST00000580828 CEP170Q5SW79 1584 aa20.91■□□□□ 0.94
SNHG25-201ENST00000580828 JPH4Q96JJ6 628 aa20.81■□□□□ 0.92
SNHG25-201ENST00000580828 CUL7Q14999 1698 aa20.8■□□□□ 0.92
SNHG25-201ENST00000580828 SHROOM2Q13796 1616 aa20.8■□□□□ 0.92
SNHG25-201ENST00000580828 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa20.78■□□□□ 0.92
SNHG25-201ENST00000580828 ERCC6L2Q5T890 1561 aa20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 8.8 ms