RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470944.1

SOD1-203, Transcript of superoxide dismutase 1, humanhuman

TSL 2

Gene SOD1, Length 1,746 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOD1-203ENST00000470944 NISCHQ9Y2I1 1504 aa68.14■■■■■ 8.5
SOD1-203ENST00000470944 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa59.97■■■■■ 7.19
SOD1-203ENST00000470944 ABCC9O60706 1549 aa57.85■■■■■ 6.85
SOD1-203ENST00000470944 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP57■■■■■ 6.71
SOD1-203ENST00000470944 DCAF8L2P0C7V8 631 aa56.63■■■■■ 6.66
SOD1-203ENST00000470944 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa56.33■■■■■ 6.61
SOD1-203ENST00000470944 NACADO15069 1562 aa56.15■■■■■ 6.58
SOD1-203ENST00000470944 MYO15BQ96JP2 1530 aa56.14■■■■■ 6.58
SOD1-203ENST00000470944 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa55.96■■■■■ 6.55
SOD1-203ENST00000470944 SCRIBQ14160 1630 aa54.99■■■■■ 6.39
SOD1-203ENST00000470944 UNC13AQ9UPW8 1703 aa54.76■■■■■ 6.36
SOD1-203ENST00000470944 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa54.69■■■■■ 6.35
SOD1-203ENST00000470944 BICRAQ9NZM4 1560 aa54.35■■■■■ 6.29
SOD1-203ENST00000470944 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP54.32■■■■■ 6.29
SOD1-203ENST00000470944 CECR2Q9BXF3 1484 aa53.07■■■■■ 6.09
SOD1-203ENST00000470944 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP52.79■■■■■ 6.04
SOD1-203ENST00000470944 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP52.7■■■■■ 6.03
SOD1-203ENST00000470944 SMARCA4P51532 1647 aa52.63■■■■■ 6.02
SOD1-203ENST00000470944 MROH2BQ7Z745 1585 aa52.61■■■■■ 6.01
SOD1-203ENST00000470944 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP52.4■■■■■ 5.98
SOD1-203ENST00000470944 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa52.32■■■■■ 5.97
SOD1-203ENST00000470944 DNAJC5BQ9UF47 199 aa52.21■■■■■ 5.95
SOD1-203ENST00000470944 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa52.1■■■■■ 5.93
SOD1-203ENST00000470944 WIZO95785 1651 aa52.08■■■■■ 5.93
SOD1-203ENST00000470944 PEG3Q9GZU2 1588 aa52.06■■■■■ 5.92
SOD1-203ENST00000470944 SMARCA2P51531 1590 aa52■■■■■ 5.92
SOD1-203ENST00000470944 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP51.98■■■■■ 5.91
SOD1-203ENST00000470944 NCAPD3P42695 1498 aa51.86■■■■■ 5.89
SOD1-203ENST00000470944 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP51.71■■■■■ 5.87
SOD1-203ENST00000470944 HMGXB3Q12766 1538 aa51.67■■■■■ 5.86
SOD1-203ENST00000470944 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP51.52■■■■■ 5.84
SOD1-203ENST00000470944 CCDC88BA6NC98 1476 aa50.99■■■■■ 5.75
SOD1-203ENST00000470944 CADPSQ9ULU8 1353 aa50.44■■■■■ 5.66
SOD1-203ENST00000470944 NESP48681 1621 aa50.42■■■■■ 5.66
SOD1-203ENST00000470944 CFTRP13569 1480 aa50.37■■■■■ 5.65
SOD1-203ENST00000470944 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa50.27■■■■■ 5.64
SOD1-203ENST00000470944 PRDM2Q13029 1718 aa49.94■■■■■ 5.58
SOD1-203ENST00000470944 PDS5BQ9NTI5 1447 aa49.92■■■■■ 5.58
SOD1-203ENST00000470944 FANCD2Q9BXW9 1451 aa49.87■■■■■ 5.57
SOD1-203ENST00000470944 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa49.75■■■■■ 5.56
SOD1-203ENST00000470944 ERCC6Q03468 1493 aa49.7■■■■■ 5.55
SOD1-203ENST00000470944 CEP164Q9UPV0 1460 aa49.68■■■■■ 5.54
SOD1-203ENST00000470944 ABCC8Q09428 1581 aa49.51■■■■■ 5.52
SOD1-203ENST00000470944 MRC2Q9UBG0 1479 aa49.37■■■■■ 5.49
SOD1-203ENST00000470944 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP49.34■■■■■ 5.49
SOD1-203ENST00000470944 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP49.34■■■■■ 5.49
SOD1-203ENST00000470944 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP49.3■■■■■ 5.48
SOD1-203ENST00000470944 CUX1P39880 1505 aa49.27■■■■■ 5.48
SOD1-203ENST00000470944 TOPBP1Q92547 1522 aa49.2■■■■■ 5.47
SOD1-203ENST00000470944 SYNJ1O43426 1573 aa49.2■■■■■ 5.47
SOD1-203ENST00000470944 DNMBPQ6XZF7 1577 aa49.19■■■■■ 5.47
SOD1-203ENST00000470944 WDR62O43379 1518 aa49.17■■■■■ 5.46
SOD1-203ENST00000470944 CHIC1Q5VXU3 224 aa49.12■■■■■ 5.45
SOD1-203ENST00000470944 TOP2BQ02880 1626 aa49.07■■■■■ 5.45
SOD1-203ENST00000470944 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa49.03■■■■■ 5.44
SOD1-203ENST00000470944 TRIM41Q8WV44 630 aa48.97■■■■■ 5.43
SOD1-203ENST00000470944 FGD5Q6ZNL6 1462 aa48.92■■■■■ 5.42
SOD1-203ENST00000470944 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP48.88■■■■■ 5.41
SOD1-203ENST00000470944 CUX2O14529 1486 aa48.77■■■■■ 5.4
SOD1-203ENST00000470944 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa48.71■■■■■ 5.39
SOD1-203ENST00000470944 SOGA1O94964 1423 aa48.68■■■■■ 5.38
SOD1-203ENST00000470944 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP48.57■■■■■ 5.37
SOD1-203ENST00000470944 IFT140Q96RY7 1462 aa48.56■■■■■ 5.36
SOD1-203ENST00000470944 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa48.45■■■■■ 5.35
SOD1-203ENST00000470944 WDR97A6NE52 1622 aa48.4■■■■■ 5.34
SOD1-203ENST00000470944 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP48.39■■■■■ 5.34
SOD1-203ENST00000470944 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP48.35■■■■■ 5.33
SOD1-203ENST00000470944 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP48.25■■■■■ 5.317e-7■■■■■ 35.6
SOD1-203ENST00000470944 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa48.24■■■■■ 5.31
SOD1-203ENST00000470944 KIF27Q86VH2 1401 aa48.18■■■■■ 5.3
SOD1-203ENST00000470944 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa48.16■■■■■ 5.3
SOD1-203ENST00000470944 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP48.16■■■■■ 5.3
SOD1-203ENST00000470944 GAPVD1Q14C86 1478 aa48.13■■■■■ 5.3
SOD1-203ENST00000470944 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP48.04■■■■■ 5.28
SOD1-203ENST00000470944 GRIN2BQ13224 1484 aa47.94■■■■■ 5.27
SOD1-203ENST00000470944 IGF1RP08069 1367 aa47.92■■■■■ 5.26
SOD1-203ENST00000470944 EEA1Q15075 1411 aa47.91■■■■■ 5.26
SOD1-203ENST00000470944 PBRM1Q86U86 1689 aa47.9■■■■■ 5.26
SOD1-203ENST00000470944 ERICH3Q5RHP9 1530 aa47.85■■■■■ 5.25
SOD1-203ENST00000470944 CSRNP3Q8WYN3 585 aa47.81■■■■■ 5.24
SOD1-203ENST00000470944 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa47.78■■■■■ 5.24
SOD1-203ENST00000470944 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP47.68■■■■■ 5.22
SOD1-203ENST00000470944 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa47.63■■■■■ 5.22
SOD1-203ENST00000470944 ADAMTS12P58397 1594 aa47.62■■■■■ 5.21
SOD1-203ENST00000470944 CUL7Q14999 1698 aa47.6■■■■■ 5.21
SOD1-203ENST00000470944 FHAD1B1AJZ9 1412 aa47.58■■■■■ 5.21
SOD1-203ENST00000470944 PRXQ9BXM0 1461 aa47.57■■■■■ 5.21
SOD1-203ENST00000470944 SYNJ2O15056 1496 aa47.5■■■■■ 5.19
SOD1-203ENST00000470944 FBLN2P98095 1184 aa47.46■■■■■ 5.19
SOD1-203ENST00000470944 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP47.44■■■■■ 5.19
SOD1-203ENST00000470944 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa47.44■■■■■ 5.18
SOD1-203ENST00000470944 EHMT2Q96KQ7 1210 aa47.42■■■■■ 5.18
SOD1-203ENST00000470944 KIF21BO75037 1637 aa47.38■■■■■ 5.18
SOD1-203ENST00000470944 GRIN2AQ12879 1464 aa47.36■■■■■ 5.17
SOD1-203ENST00000470944 CHD1O14646 1710 aa47.32■■■■■ 5.17
SOD1-203ENST00000470944 GOLGA3Q08378 1498 aa47.23■■■■■ 5.15
SOD1-203ENST00000470944 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa47.21■■■■■ 5.15
SOD1-203ENST00000470944 CEP170Q5SW79 1584 aa47.1■■■■■ 5.13
SOD1-203ENST00000470944 NUP160Q12769 1436 aa47.09■■■■■ 5.13
SOD1-203ENST00000470944 UBTFP17480 764 aaKnown RBP47.07■■■■■ 5.13
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