Protein–RNA interactions for Protein: Q14956

GPNMB, Transmembrane glycoprotein NMB, humanhuman

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Length 572 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPNMBQ14956 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
GPNMBQ14956 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GPNMBQ14956 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
GPNMBQ14956 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
GPNMBQ14956 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GPNMBQ14956 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
GPNMBQ14956 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GPNMBQ14956 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
GPNMBQ14956 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GPNMBQ14956 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
GPNMBQ14956 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
GPNMBQ14956 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
GPNMBQ14956 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GPNMBQ14956 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GPNMBQ14956 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
GPNMBQ14956 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GPNMBQ14956 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GPNMBQ14956 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GPNMBQ14956 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
GPNMBQ14956 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GPNMBQ14956 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
GPNMBQ14956 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GPNMBQ14956 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GPNMBQ14956 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
GPNMBQ14956 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GPNMBQ14956 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
GPNMBQ14956 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
GPNMBQ14956 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GPNMBQ14956 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
GPNMBQ14956 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
GPNMBQ14956 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GPNMBQ14956 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
GPNMBQ14956 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
GPNMBQ14956 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
GPNMBQ14956 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
GPNMBQ14956 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GPNMBQ14956 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
GPNMBQ14956 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GPNMBQ14956 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
GPNMBQ14956 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GPNMBQ14956 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GPNMBQ14956 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GPNMBQ14956 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GPNMBQ14956 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GPNMBQ14956 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
GPNMBQ14956 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
GPNMBQ14956 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GPNMBQ14956 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GPNMBQ14956 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GPNMBQ14956 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GPNMBQ14956 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GPNMBQ14956 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
GPNMBQ14956 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GPNMBQ14956 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
GPNMBQ14956 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
GPNMBQ14956 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
GPNMBQ14956 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GPNMBQ14956 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GPNMBQ14956 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GPNMBQ14956 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
GPNMBQ14956 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GPNMBQ14956 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
GPNMBQ14956 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GPNMBQ14956 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GPNMBQ14956 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GPNMBQ14956 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
GPNMBQ14956 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GPNMBQ14956 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
GPNMBQ14956 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GPNMBQ14956 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
GPNMBQ14956 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
GPNMBQ14956 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GPNMBQ14956 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
GPNMBQ14956 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
GPNMBQ14956 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
GPNMBQ14956 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
GPNMBQ14956 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GPNMBQ14956 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
GPNMBQ14956 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
GPNMBQ14956 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GPNMBQ14956 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
GPNMBQ14956 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
GPNMBQ14956 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
GPNMBQ14956 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
GPNMBQ14956 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
GPNMBQ14956 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
GPNMBQ14956 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GPNMBQ14956 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
GPNMBQ14956 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
GPNMBQ14956 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
GPNMBQ14956 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GPNMBQ14956 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GPNMBQ14956 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GPNMBQ14956 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GPNMBQ14956 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
GPNMBQ14956 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
GPNMBQ14956 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
GPNMBQ14956 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GPNMBQ14956 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
GPNMBQ14956 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
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