Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GBX1Q14549 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GBX1Q14549 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GBX1Q14549 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GBX1Q14549 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GBX1Q14549 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
GBX1Q14549 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GBX1Q14549 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GBX1Q14549 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GBX1Q14549 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GBX1Q14549 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GBX1Q14549 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GBX1Q14549 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GBX1Q14549 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GBX1Q14549 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GBX1Q14549 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GBX1Q14549 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
GBX1Q14549 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
GBX1Q14549 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GBX1Q14549 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
GBX1Q14549 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
GBX1Q14549 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
GBX1Q14549 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
GBX1Q14549 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GBX1Q14549 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
GBX1Q14549 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
GBX1Q14549 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
GBX1Q14549 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GBX1Q14549 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
GBX1Q14549 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
GBX1Q14549 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
GBX1Q14549 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GBX1Q14549 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
GBX1Q14549 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GBX1Q14549 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
GBX1Q14549 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GBX1Q14549 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GBX1Q14549 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GBX1Q14549 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GBX1Q14549 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
GBX1Q14549 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
GBX1Q14549 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
GBX1Q14549 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GBX1Q14549 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
GBX1Q14549 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GBX1Q14549 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GBX1Q14549 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GBX1Q14549 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GBX1Q14549 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GBX1Q14549 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GBX1Q14549 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GBX1Q14549 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GBX1Q14549 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GBX1Q14549 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GBX1Q14549 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GBX1Q14549 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GBX1Q14549 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
GBX1Q14549 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.84■■□□□ 1.57
GBX1Q14549 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
GBX1Q14549 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GBX1Q14549 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GBX1Q14549 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
GBX1Q14549 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
GBX1Q14549 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GBX1Q14549 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
GBX1Q14549 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
GBX1Q14549 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GBX1Q14549 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
GBX1Q14549 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GBX1Q14549 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GBX1Q14549 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
GBX1Q14549 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GBX1Q14549 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GBX1Q14549 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GBX1Q14549 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
GBX1Q14549 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
GBX1Q14549 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GBX1Q14549 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
GBX1Q14549 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GBX1Q14549 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GBX1Q14549 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GBX1Q14549 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
GBX1Q14549 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GBX1Q14549 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
GBX1Q14549 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
GBX1Q14549 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GBX1Q14549 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GBX1Q14549 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
GBX1Q14549 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GBX1Q14549 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
GBX1Q14549 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GBX1Q14549 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
GBX1Q14549 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GBX1Q14549 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
GBX1Q14549 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GBX1Q14549 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
GBX1Q14549 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GBX1Q14549 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
GBX1Q14549 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
GBX1Q14549 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
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