Protein–RNA interactions for Protein: Q14123

PDE1C, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1C, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 709 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1CQ14123 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
PDE1CQ14123 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PDE1CQ14123 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PDE1CQ14123 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PDE1CQ14123 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDE1CQ14123 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
PDE1CQ14123 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
PDE1CQ14123 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDE1CQ14123 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDE1CQ14123 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
PDE1CQ14123 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE1CQ14123 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PDE1CQ14123 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDE1CQ14123 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDE1CQ14123 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
PDE1CQ14123 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDE1CQ14123 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDE1CQ14123 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDE1CQ14123 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
PDE1CQ14123 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE1CQ14123 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE1CQ14123 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE1CQ14123 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE1CQ14123 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PDE1CQ14123 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE1CQ14123 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE1CQ14123 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE1CQ14123 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE1CQ14123 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE1CQ14123 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE1CQ14123 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE1CQ14123 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE1CQ14123 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE1CQ14123 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE1CQ14123 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE1CQ14123 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE1CQ14123 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE1CQ14123 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE1CQ14123 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE1CQ14123 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
PDE1CQ14123 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE1CQ14123 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE1CQ14123 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE1CQ14123 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PDE1CQ14123 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PDE1CQ14123 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE1CQ14123 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE1CQ14123 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE1CQ14123 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE1CQ14123 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PDE1CQ14123 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE1CQ14123 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE1CQ14123 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE1CQ14123 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PDE1CQ14123 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE1CQ14123 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE1CQ14123 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE1CQ14123 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE1CQ14123 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE1CQ14123 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PDE1CQ14123 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE1CQ14123 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE1CQ14123 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE1CQ14123 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PDE1CQ14123 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE1CQ14123 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE1CQ14123 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PDE1CQ14123 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE1CQ14123 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE1CQ14123 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE1CQ14123 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE1CQ14123 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE1CQ14123 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PDE1CQ14123 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE1CQ14123 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE1CQ14123 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE1CQ14123 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE1CQ14123 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE1CQ14123 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE1CQ14123 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE1CQ14123 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE1CQ14123 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE1CQ14123 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PDE1CQ14123 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDE1CQ14123 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDE1CQ14123 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDE1CQ14123 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDE1CQ14123 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDE1CQ14123 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PDE1CQ14123 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDE1CQ14123 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDE1CQ14123 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDE1CQ14123 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDE1CQ14123 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDE1CQ14123 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDE1CQ14123 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDE1CQ14123 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDE1CQ14123 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDE1CQ14123 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDE1CQ14123 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
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