Protein–RNA interactions for Protein: Q13936

CACNA1C, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1C, humanhuman

Predictions only

Length 2,221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1CQ13936 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA1CQ13936 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
CACNA1CQ13936 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNA1CQ13936 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNA1CQ13936 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNA1CQ13936 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNA1CQ13936 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNA1CQ13936 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNA1CQ13936 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
CACNA1CQ13936 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNA1CQ13936 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNA1CQ13936 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNA1CQ13936 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNA1CQ13936 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
CACNA1CQ13936 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNA1CQ13936 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNA1CQ13936 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNA1CQ13936 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
CACNA1CQ13936 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNA1CQ13936 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNA1CQ13936 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNA1CQ13936 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNA1CQ13936 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNA1CQ13936 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNA1CQ13936 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNA1CQ13936 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNA1CQ13936 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNA1CQ13936 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNA1CQ13936 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNA1CQ13936 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNA1CQ13936 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNA1CQ13936 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
CACNA1CQ13936 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNA1CQ13936 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNA1CQ13936 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNA1CQ13936 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
CACNA1CQ13936 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
CACNA1CQ13936 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
CACNA1CQ13936 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNA1CQ13936 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNA1CQ13936 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNA1CQ13936 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
CACNA1CQ13936 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
CACNA1CQ13936 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNA1CQ13936 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNA1CQ13936 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
CACNA1CQ13936 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA1CQ13936 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA1CQ13936 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA1CQ13936 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
CACNA1CQ13936 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA1CQ13936 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA1CQ13936 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA1CQ13936 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA1CQ13936 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA1CQ13936 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA1CQ13936 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CACNA1CQ13936 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA1CQ13936 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA1CQ13936 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA1CQ13936 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA1CQ13936 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA1CQ13936 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA1CQ13936 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA1CQ13936 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA1CQ13936 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA1CQ13936 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA1CQ13936 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CACNA1CQ13936 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.27
CACNA1CQ13936 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNA1CQ13936 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CACNA1CQ13936 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA1CQ13936 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA1CQ13936 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA1CQ13936 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA1CQ13936 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA1CQ13936 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CACNA1CQ13936 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA1CQ13936 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA1CQ13936 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CACNA1CQ13936 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA1CQ13936 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA1CQ13936 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA1CQ13936 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA1CQ13936 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CACNA1CQ13936 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA1CQ13936 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA1CQ13936 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA1CQ13936 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA1CQ13936 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CACNA1CQ13936 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA1CQ13936 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA1CQ13936 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA1CQ13936 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA1CQ13936 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CACNA1CQ13936 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CACNA1CQ13936 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
CACNA1CQ13936 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CACNA1CQ13936 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
CACNA1CQ13936 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
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