Protein–RNA interactions for Protein: Q13487

SNAPC2, snRNA-activating protein complex subunit 2, humanhuman

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Length 334 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNAPC2Q13487 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SNAPC2Q13487 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SNAPC2Q13487 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SNAPC2Q13487 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SNAPC2Q13487 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SNAPC2Q13487 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SNAPC2Q13487 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SNAPC2Q13487 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
SNAPC2Q13487 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SNAPC2Q13487 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SNAPC2Q13487 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SNAPC2Q13487 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
SNAPC2Q13487 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SNAPC2Q13487 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SNAPC2Q13487 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SNAPC2Q13487 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SNAPC2Q13487 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SNAPC2Q13487 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SNAPC2Q13487 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SNAPC2Q13487 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SNAPC2Q13487 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SNAPC2Q13487 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SNAPC2Q13487 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SNAPC2Q13487 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
SNAPC2Q13487 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SNAPC2Q13487 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SNAPC2Q13487 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SNAPC2Q13487 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SNAPC2Q13487 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.81■■■□□ 2.36
SNAPC2Q13487 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SNAPC2Q13487 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.8■■■□□ 2.36
SNAPC2Q13487 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SNAPC2Q13487 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SNAPC2Q13487 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SNAPC2Q13487 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SNAPC2Q13487 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
SNAPC2Q13487 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SNAPC2Q13487 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SNAPC2Q13487 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SNAPC2Q13487 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SNAPC2Q13487 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
SNAPC2Q13487 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.76■■■□□ 2.35
SNAPC2Q13487 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SNAPC2Q13487 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SNAPC2Q13487 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SNAPC2Q13487 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SNAPC2Q13487 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
SNAPC2Q13487 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SNAPC2Q13487 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SNAPC2Q13487 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC29.73■■■□□ 2.35
SNAPC2Q13487 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SNAPC2Q13487 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SNAPC2Q13487 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SNAPC2Q13487 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SNAPC2Q13487 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SNAPC2Q13487 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SNAPC2Q13487 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SNAPC2Q13487 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SNAPC2Q13487 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SNAPC2Q13487 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SNAPC2Q13487 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SNAPC2Q13487 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SNAPC2Q13487 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SNAPC2Q13487 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SNAPC2Q13487 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SNAPC2Q13487 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SNAPC2Q13487 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SNAPC2Q13487 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SNAPC2Q13487 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SNAPC2Q13487 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SNAPC2Q13487 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
SNAPC2Q13487 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
SNAPC2Q13487 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
SNAPC2Q13487 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SNAPC2Q13487 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SNAPC2Q13487 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
SNAPC2Q13487 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
SNAPC2Q13487 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SNAPC2Q13487 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
SNAPC2Q13487 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.33
SNAPC2Q13487 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC29.63■■■□□ 2.33
SNAPC2Q13487 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SNAPC2Q13487 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SNAPC2Q13487 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SNAPC2Q13487 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.62■■■□□ 2.33
SNAPC2Q13487 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
SNAPC2Q13487 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
SNAPC2Q13487 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SNAPC2Q13487 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
SNAPC2Q13487 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SNAPC2Q13487 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SNAPC2Q13487 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC29.61■■■□□ 2.33
SNAPC2Q13487 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SNAPC2Q13487 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SNAPC2Q13487 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SNAPC2Q13487 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
SNAPC2Q13487 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
SNAPC2Q13487 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SNAPC2Q13487 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
SNAPC2Q13487 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
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