Protein–RNA interactions for Protein: Q13219

PAPPA, Pappalysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPPAQ13219 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PAPPAQ13219 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PAPPAQ13219 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PAPPAQ13219 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC33.42■■■□□ 2.94
PAPPAQ13219 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PAPPAQ13219 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PAPPAQ13219 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.94
PAPPAQ13219 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PAPPAQ13219 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC33.39■■■□□ 2.94
PAPPAQ13219 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC33.39■■■□□ 2.93
PAPPAQ13219 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
PAPPAQ13219 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PAPPAQ13219 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PAPPAQ13219 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PAPPAQ13219 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC33.36■■■□□ 2.93
PAPPAQ13219 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PAPPAQ13219 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PAPPAQ13219 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PAPPAQ13219 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PAPPAQ13219 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
PAPPAQ13219 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC33.35■■■□□ 2.93
PAPPAQ13219 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PAPPAQ13219 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PAPPAQ13219 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PAPPAQ13219 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PAPPAQ13219 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
PAPPAQ13219 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
PAPPAQ13219 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC33.33■■■□□ 2.93
PAPPAQ13219 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
PAPPAQ13219 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
PAPPAQ13219 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
PAPPAQ13219 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC33.32■■■□□ 2.92
PAPPAQ13219 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.31■■■□□ 2.92
PAPPAQ13219 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PAPPAQ13219 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PAPPAQ13219 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
PAPPAQ13219 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
PAPPAQ13219 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
PAPPAQ13219 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
PAPPAQ13219 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.28■■■□□ 2.92
PAPPAQ13219 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC33.28■■■□□ 2.92
PAPPAQ13219 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
PAPPAQ13219 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC33.27■■■□□ 2.92
PAPPAQ13219 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC33.26■■■□□ 2.91
PAPPAQ13219 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PAPPAQ13219 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC33.25■■■□□ 2.91
PAPPAQ13219 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PAPPAQ13219 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PAPPAQ13219 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC33.25■■■□□ 2.91
PAPPAQ13219 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
PAPPAQ13219 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
PAPPAQ13219 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PAPPAQ13219 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PAPPAQ13219 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PAPPAQ13219 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PAPPAQ13219 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
PAPPAQ13219 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PAPPAQ13219 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
PAPPAQ13219 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
PAPPAQ13219 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
PAPPAQ13219 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PAPPAQ13219 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC33.23■■■□□ 2.91
PAPPAQ13219 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PAPPAQ13219 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PAPPAQ13219 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PAPPAQ13219 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PAPPAQ13219 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PAPPAQ13219 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PAPPAQ13219 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PAPPAQ13219 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PAPPAQ13219 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
PAPPAQ13219 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
PAPPAQ13219 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
PAPPAQ13219 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC33.2■■■□□ 2.91
PAPPAQ13219 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
PAPPAQ13219 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
PAPPAQ13219 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PAPPAQ13219 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
PAPPAQ13219 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
PAPPAQ13219 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
PAPPAQ13219 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PAPPAQ13219 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PAPPAQ13219 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PAPPAQ13219 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.18■■■□□ 2.9
PAPPAQ13219 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC33.17■■■□□ 2.9
PAPPAQ13219 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PAPPAQ13219 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC33.17■■■□□ 2.9
PAPPAQ13219 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.16■■■□□ 2.9
PAPPAQ13219 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PAPPAQ13219 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PAPPAQ13219 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
PAPPAQ13219 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
PAPPAQ13219 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PAPPAQ13219 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PAPPAQ13219 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PAPPAQ13219 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PAPPAQ13219 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
PAPPAQ13219 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC33.13■■■□□ 2.89
PAPPAQ13219 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
PAPPAQ13219 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms