Protein–RNA interactions for Protein: Q12913

PTPRJ, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase eta, humanhuman

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Length 1,337 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRJQ12913 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PTPRJQ12913 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
PTPRJQ12913 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPRJQ12913 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
PTPRJQ12913 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRJQ12913 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PTPRJQ12913 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
PTPRJQ12913 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
PTPRJQ12913 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRJQ12913 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRJQ12913 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRJQ12913 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRJQ12913 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRJQ12913 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRJQ12913 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRJQ12913 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRJQ12913 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
PTPRJQ12913 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPRJQ12913 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPRJQ12913 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPRJQ12913 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPRJQ12913 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPRJQ12913 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PTPRJQ12913 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC27.58■■■□□ 2
PTPRJQ12913 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTPRJQ12913 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
PTPRJQ12913 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
PTPRJQ12913 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTPRJQ12913 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC27.55■■■□□ 2
PTPRJQ12913 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTPRJQ12913 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
PTPRJQ12913 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.54■■■□□ 2
PTPRJQ12913 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRJQ12913 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRJQ12913 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRJQ12913 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRJQ12913 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PTPRJQ12913 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PTPRJQ12913 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PTPRJQ12913 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PTPRJQ12913 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRJQ12913 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRJQ12913 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRJQ12913 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRJQ12913 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRJQ12913 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRJQ12913 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRJQ12913 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRJQ12913 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PTPRJQ12913 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRJQ12913 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRJQ12913 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRJQ12913 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PTPRJQ12913 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRJQ12913 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRJQ12913 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRJQ12913 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PTPRJQ12913 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRJQ12913 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PTPRJQ12913 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPRJQ12913 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PTPRJQ12913 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PTPRJQ12913 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.99
PTPRJQ12913 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PTPRJQ12913 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PTPRJQ12913 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
PTPRJQ12913 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PTPRJQ12913 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRJQ12913 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRJQ12913 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRJQ12913 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRJQ12913 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
PTPRJQ12913 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRJQ12913 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRJQ12913 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRJQ12913 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
PTPRJQ12913 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRJQ12913 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRJQ12913 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRJQ12913 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
PTPRJQ12913 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PTPRJQ12913 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRJQ12913 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRJQ12913 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRJQ12913 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRJQ12913 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRJQ12913 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRJQ12913 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PTPRJQ12913 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.39■■□□□ 1.97
PTPRJQ12913 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.97
PTPRJQ12913 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
PTPRJQ12913 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRJQ12913 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRJQ12913 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PTPRJQ12913 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRJQ12913 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRJQ12913 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRJQ12913 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
PTPRJQ12913 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PTPRJQ12913 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
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