Protein–RNA interactions for Protein: Q12907

LMAN2, Vesicular integral-membrane protein VIP36, humanhuman

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Length 356 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMAN2Q12907 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMAN2Q12907 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMAN2Q12907 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMAN2Q12907 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
LMAN2Q12907 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMAN2Q12907 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMAN2Q12907 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
LMAN2Q12907 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
LMAN2Q12907 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMAN2Q12907 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMAN2Q12907 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
LMAN2Q12907 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMAN2Q12907 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMAN2Q12907 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMAN2Q12907 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
LMAN2Q12907 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMAN2Q12907 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
LMAN2Q12907 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMAN2Q12907 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
LMAN2Q12907 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMAN2Q12907 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMAN2Q12907 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMAN2Q12907 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMAN2Q12907 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMAN2Q12907 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMAN2Q12907 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMAN2Q12907 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
LMAN2Q12907 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LMAN2Q12907 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
LMAN2Q12907 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMAN2Q12907 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMAN2Q12907 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
LMAN2Q12907 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMAN2Q12907 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMAN2Q12907 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMAN2Q12907 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMAN2Q12907 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMAN2Q12907 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
LMAN2Q12907 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMAN2Q12907 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMAN2Q12907 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
LMAN2Q12907 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMAN2Q12907 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMAN2Q12907 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
LMAN2Q12907 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
LMAN2Q12907 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
LMAN2Q12907 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMAN2Q12907 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMAN2Q12907 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMAN2Q12907 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMAN2Q12907 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
LMAN2Q12907 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26■■□□□ 1.75
LMAN2Q12907 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
LMAN2Q12907 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
LMAN2Q12907 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMAN2Q12907 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMAN2Q12907 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMAN2Q12907 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMAN2Q12907 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
LMAN2Q12907 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
LMAN2Q12907 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMAN2Q12907 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMAN2Q12907 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMAN2Q12907 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMAN2Q12907 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
LMAN2Q12907 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMAN2Q12907 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMAN2Q12907 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMAN2Q12907 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
LMAN2Q12907 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMAN2Q12907 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMAN2Q12907 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
LMAN2Q12907 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
LMAN2Q12907 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
LMAN2Q12907 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
LMAN2Q12907 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
LMAN2Q12907 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMAN2Q12907 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMAN2Q12907 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMAN2Q12907 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
LMAN2Q12907 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMAN2Q12907 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMAN2Q12907 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMAN2Q12907 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMAN2Q12907 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
LMAN2Q12907 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMAN2Q12907 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMAN2Q12907 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMAN2Q12907 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
LMAN2Q12907 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMAN2Q12907 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMAN2Q12907 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
LMAN2Q12907 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMAN2Q12907 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMAN2Q12907 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMAN2Q12907 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
LMAN2Q12907 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMAN2Q12907 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMAN2Q12907 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
LMAN2Q12907 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
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