Protein–RNA interactions for Protein: Q08499

PDE4D, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4D, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4DQ08499 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PDE4DQ08499 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PDE4DQ08499 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PDE4DQ08499 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PDE4DQ08499 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
PDE4DQ08499 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
PDE4DQ08499 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PDE4DQ08499 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PDE4DQ08499 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PDE4DQ08499 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
PDE4DQ08499 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
PDE4DQ08499 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PDE4DQ08499 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
PDE4DQ08499 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
PDE4DQ08499 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.27
PDE4DQ08499 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.2■■■□□ 2.27
PDE4DQ08499 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PDE4DQ08499 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
PDE4DQ08499 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PDE4DQ08499 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PDE4DQ08499 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.19■■■□□ 2.26
PDE4DQ08499 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
PDE4DQ08499 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PDE4DQ08499 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PDE4DQ08499 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
PDE4DQ08499 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
PDE4DQ08499 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.17■■■□□ 2.26
PDE4DQ08499 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
PDE4DQ08499 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.16■■■□□ 2.26
PDE4DQ08499 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PDE4DQ08499 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
PDE4DQ08499 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PDE4DQ08499 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PDE4DQ08499 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PDE4DQ08499 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PDE4DQ08499 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.15■■■□□ 2.26
PDE4DQ08499 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
PDE4DQ08499 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PDE4DQ08499 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PDE4DQ08499 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
PDE4DQ08499 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.14■■■□□ 2.26
PDE4DQ08499 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PDE4DQ08499 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PDE4DQ08499 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PDE4DQ08499 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PDE4DQ08499 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
PDE4DQ08499 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PDE4DQ08499 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PDE4DQ08499 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PDE4DQ08499 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PDE4DQ08499 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
PDE4DQ08499 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
PDE4DQ08499 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PDE4DQ08499 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PDE4DQ08499 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PDE4DQ08499 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PDE4DQ08499 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PDE4DQ08499 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PDE4DQ08499 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PDE4DQ08499 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PDE4DQ08499 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PDE4DQ08499 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
PDE4DQ08499 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PDE4DQ08499 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PDE4DQ08499 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
PDE4DQ08499 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PDE4DQ08499 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PDE4DQ08499 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PDE4DQ08499 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PDE4DQ08499 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PDE4DQ08499 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
PDE4DQ08499 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PDE4DQ08499 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PDE4DQ08499 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PDE4DQ08499 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PDE4DQ08499 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PDE4DQ08499 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PDE4DQ08499 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PDE4DQ08499 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.04■■■□□ 2.24
PDE4DQ08499 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PDE4DQ08499 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PDE4DQ08499 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
PDE4DQ08499 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PDE4DQ08499 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PDE4DQ08499 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PDE4DQ08499 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PDE4DQ08499 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
PDE4DQ08499 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.01■■■□□ 2.24
PDE4DQ08499 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
PDE4DQ08499 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PDE4DQ08499 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PDE4DQ08499 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PDE4DQ08499 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PDE4DQ08499 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PDE4DQ08499 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PDE4DQ08499 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
PDE4DQ08499 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PDE4DQ08499 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
PDE4DQ08499 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PDE4DQ08499 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms