Protein–RNA interactions for Protein: Q08043

ACTN3, Alpha-actinin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTN3Q08043 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ACTN3Q08043 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ACTN3Q08043 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
ACTN3Q08043 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ACTN3Q08043 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ACTN3Q08043 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ACTN3Q08043 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ACTN3Q08043 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
ACTN3Q08043 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ACTN3Q08043 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ACTN3Q08043 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ACTN3Q08043 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACTN3Q08043 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACTN3Q08043 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACTN3Q08043 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ACTN3Q08043 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ACTN3Q08043 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ACTN3Q08043 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ACTN3Q08043 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ACTN3Q08043 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACTN3Q08043 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ACTN3Q08043 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACTN3Q08043 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACTN3Q08043 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ACTN3Q08043 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACTN3Q08043 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACTN3Q08043 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACTN3Q08043 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.4■■□□□ 1.66
ACTN3Q08043 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ACTN3Q08043 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ACTN3Q08043 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ACTN3Q08043 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ACTN3Q08043 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
ACTN3Q08043 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACTN3Q08043 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACTN3Q08043 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACTN3Q08043 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACTN3Q08043 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACTN3Q08043 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACTN3Q08043 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ACTN3Q08043 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACTN3Q08043 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACTN3Q08043 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACTN3Q08043 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ACTN3Q08043 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACTN3Q08043 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACTN3Q08043 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACTN3Q08043 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ACTN3Q08043 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACTN3Q08043 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ACTN3Q08043 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ACTN3Q08043 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACTN3Q08043 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ACTN3Q08043 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACTN3Q08043 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACTN3Q08043 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ACTN3Q08043 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ACTN3Q08043 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACTN3Q08043 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACTN3Q08043 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACTN3Q08043 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACTN3Q08043 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACTN3Q08043 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ACTN3Q08043 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ACTN3Q08043 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ACTN3Q08043 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ACTN3Q08043 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ACTN3Q08043 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ACTN3Q08043 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ACTN3Q08043 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ACTN3Q08043 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ACTN3Q08043 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ACTN3Q08043 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACTN3Q08043 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACTN3Q08043 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ACTN3Q08043 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
ACTN3Q08043 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ACTN3Q08043 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACTN3Q08043 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACTN3Q08043 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACTN3Q08043 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACTN3Q08043 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACTN3Q08043 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACTN3Q08043 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ACTN3Q08043 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ACTN3Q08043 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
ACTN3Q08043 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ACTN3Q08043 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ACTN3Q08043 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACTN3Q08043 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACTN3Q08043 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACTN3Q08043 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACTN3Q08043 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ACTN3Q08043 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACTN3Q08043 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACTN3Q08043 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACTN3Q08043 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ACTN3Q08043 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACTN3Q08043 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
ACTN3Q08043 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms