Protein–RNA interactions for Protein: Q06830

PRDX1, Peroxiredoxin-1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDX1Q06830 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRDX1Q06830 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRDX1Q06830 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRDX1Q06830 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRDX1Q06830 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
PRDX1Q06830 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRDX1Q06830 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
PRDX1Q06830 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRDX1Q06830 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRDX1Q06830 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRDX1Q06830 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PRDX1Q06830 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDX1Q06830 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDX1Q06830 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDX1Q06830 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
PRDX1Q06830 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRDX1Q06830 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRDX1Q06830 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PRDX1Q06830 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
PRDX1Q06830 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRDX1Q06830 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PRDX1Q06830 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PRDX1Q06830 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRDX1Q06830 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
PRDX1Q06830 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRDX1Q06830 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRDX1Q06830 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRDX1Q06830 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRDX1Q06830 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PRDX1Q06830 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRDX1Q06830 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRDX1Q06830 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
PRDX1Q06830 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
PRDX1Q06830 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRDX1Q06830 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRDX1Q06830 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRDX1Q06830 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRDX1Q06830 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PRDX1Q06830 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRDX1Q06830 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRDX1Q06830 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PRDX1Q06830 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
PRDX1Q06830 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRDX1Q06830 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRDX1Q06830 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRDX1Q06830 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRDX1Q06830 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PRDX1Q06830 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRDX1Q06830 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRDX1Q06830 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRDX1Q06830 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PRDX1Q06830 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRDX1Q06830 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
PRDX1Q06830 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PRDX1Q06830 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRDX1Q06830 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRDX1Q06830 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRDX1Q06830 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRDX1Q06830 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PRDX1Q06830 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRDX1Q06830 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PRDX1Q06830 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRDX1Q06830 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRDX1Q06830 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PRDX1Q06830 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRDX1Q06830 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRDX1Q06830 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PRDX1Q06830 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRDX1Q06830 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRDX1Q06830 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRDX1Q06830 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRDX1Q06830 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRDX1Q06830 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRDX1Q06830 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PRDX1Q06830 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDX1Q06830 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDX1Q06830 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDX1Q06830 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDX1Q06830 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PRDX1Q06830 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PRDX1Q06830 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PRDX1Q06830 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
PRDX1Q06830 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDX1Q06830 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDX1Q06830 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDX1Q06830 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDX1Q06830 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PRDX1Q06830 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRDX1Q06830 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRDX1Q06830 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRDX1Q06830 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PRDX1Q06830 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PRDX1Q06830 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PRDX1Q06830 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
PRDX1Q06830 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
PRDX1Q06830 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDX1Q06830 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDX1Q06830 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDX1Q06830 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PRDX1Q06830 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms