Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SLC18A2Q05940 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC18A2Q05940 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC18A2Q05940 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC18A2Q05940 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC18A2Q05940 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC18A2Q05940 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SLC18A2Q05940 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC18A2Q05940 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC18A2Q05940 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SLC18A2Q05940 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC18A2Q05940 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SLC18A2Q05940 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC18A2Q05940 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC18A2Q05940 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC18A2Q05940 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SLC18A2Q05940 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC18A2Q05940 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC18A2Q05940 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC18A2Q05940 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC18A2Q05940 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC18A2Q05940 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SLC18A2Q05940 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC18A2Q05940 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC18A2Q05940 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC18A2Q05940 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC18A2Q05940 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SLC18A2Q05940 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC18A2Q05940 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC18A2Q05940 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC18A2Q05940 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC18A2Q05940 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SLC18A2Q05940 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
SLC18A2Q05940 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC18A2Q05940 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC18A2Q05940 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC18A2Q05940 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC18A2Q05940 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SLC18A2Q05940 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC18A2Q05940 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SLC18A2Q05940 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC18A2Q05940 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SLC18A2Q05940 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC18A2Q05940 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SLC18A2Q05940 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC18A2Q05940 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC18A2Q05940 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC18A2Q05940 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SLC18A2Q05940 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC18A2Q05940 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC18A2Q05940 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC18A2Q05940 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC18A2Q05940 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
SLC18A2Q05940 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC18A2Q05940 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC18A2Q05940 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC18A2Q05940 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
SLC18A2Q05940 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC18A2Q05940 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC18A2Q05940 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC18A2Q05940 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SLC18A2Q05940 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC18A2Q05940 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC18A2Q05940 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC18A2Q05940 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC18A2Q05940 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC18A2Q05940 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC18A2Q05940 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SLC18A2Q05940 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC18A2Q05940 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SLC18A2Q05940 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC18A2Q05940 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC18A2Q05940 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SLC18A2Q05940 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC18A2Q05940 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC18A2Q05940 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
SLC18A2Q05940 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC18A2Q05940 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
SLC18A2Q05940 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
SLC18A2Q05940 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
SLC18A2Q05940 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC18A2Q05940 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
SLC18A2Q05940 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC18A2Q05940 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
SLC18A2Q05940 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SLC18A2Q05940 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC18A2Q05940 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC18A2Q05940 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC18A2Q05940 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC18A2Q05940 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC18A2Q05940 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC18A2Q05940 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC18A2Q05940 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC18A2Q05940 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SLC18A2Q05940 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC18A2Q05940 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC18A2Q05940 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC18A2Q05940 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
SLC18A2Q05940 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SLC18A2Q05940 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms