Protein–RNA interactions for Protein: Q01064

PDE1B, Calcium/calmodulin-dependent 3',5'-cyclic nucleotide phosphodiesterase 1B, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE1BQ01064 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE1BQ01064 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE1BQ01064 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE1BQ01064 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE1BQ01064 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PDE1BQ01064 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE1BQ01064 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE1BQ01064 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE1BQ01064 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE1BQ01064 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE1BQ01064 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE1BQ01064 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE1BQ01064 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE1BQ01064 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PDE1BQ01064 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDE1BQ01064 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDE1BQ01064 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDE1BQ01064 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PDE1BQ01064 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDE1BQ01064 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDE1BQ01064 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDE1BQ01064 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDE1BQ01064 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PDE1BQ01064 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDE1BQ01064 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDE1BQ01064 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDE1BQ01064 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDE1BQ01064 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDE1BQ01064 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PDE1BQ01064 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDE1BQ01064 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDE1BQ01064 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDE1BQ01064 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDE1BQ01064 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDE1BQ01064 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDE1BQ01064 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDE1BQ01064 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDE1BQ01064 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDE1BQ01064 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDE1BQ01064 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDE1BQ01064 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDE1BQ01064 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDE1BQ01064 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDE1BQ01064 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PDE1BQ01064 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDE1BQ01064 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDE1BQ01064 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDE1BQ01064 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDE1BQ01064 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDE1BQ01064 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDE1BQ01064 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDE1BQ01064 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDE1BQ01064 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDE1BQ01064 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PDE1BQ01064 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PDE1BQ01064 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PDE1BQ01064 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDE1BQ01064 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PDE1BQ01064 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PDE1BQ01064 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDE1BQ01064 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDE1BQ01064 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDE1BQ01064 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDE1BQ01064 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PDE1BQ01064 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PDE1BQ01064 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDE1BQ01064 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDE1BQ01064 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDE1BQ01064 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PDE1BQ01064 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
PDE1BQ01064 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDE1BQ01064 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDE1BQ01064 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PDE1BQ01064 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDE1BQ01064 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDE1BQ01064 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDE1BQ01064 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDE1BQ01064 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PDE1BQ01064 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDE1BQ01064 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDE1BQ01064 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDE1BQ01064 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PDE1BQ01064 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
PDE1BQ01064 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDE1BQ01064 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
PDE1BQ01064 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDE1BQ01064 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDE1BQ01064 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
PDE1BQ01064 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE1BQ01064 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE1BQ01064 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE1BQ01064 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE1BQ01064 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE1BQ01064 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
PDE1BQ01064 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDE1BQ01064 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDE1BQ01064 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDE1BQ01064 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDE1BQ01064 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
PDE1BQ01064 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35 ms