Protein–RNA interactions for Protein: Q00587

CDC42EP1, Cdc42 effector protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP1Q00587 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDC42EP1Q00587 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDC42EP1Q00587 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CDC42EP1Q00587 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CDC42EP1Q00587 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDC42EP1Q00587 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
CDC42EP1Q00587 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDC42EP1Q00587 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDC42EP1Q00587 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDC42EP1Q00587 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CDC42EP1Q00587 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDC42EP1Q00587 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDC42EP1Q00587 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDC42EP1Q00587 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CDC42EP1Q00587 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CDC42EP1Q00587 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CDC42EP1Q00587 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CDC42EP1Q00587 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDC42EP1Q00587 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDC42EP1Q00587 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDC42EP1Q00587 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDC42EP1Q00587 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CDC42EP1Q00587 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDC42EP1Q00587 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDC42EP1Q00587 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDC42EP1Q00587 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CDC42EP1Q00587 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDC42EP1Q00587 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDC42EP1Q00587 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDC42EP1Q00587 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CDC42EP1Q00587 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDC42EP1Q00587 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CDC42EP1Q00587 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDC42EP1Q00587 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CDC42EP1Q00587 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CDC42EP1Q00587 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CDC42EP1Q00587 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CDC42EP1Q00587 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CDC42EP1Q00587 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDC42EP1Q00587 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDC42EP1Q00587 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CDC42EP1Q00587 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CDC42EP1Q00587 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDC42EP1Q00587 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDC42EP1Q00587 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CDC42EP1Q00587 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDC42EP1Q00587 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDC42EP1Q00587 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDC42EP1Q00587 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDC42EP1Q00587 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDC42EP1Q00587 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CDC42EP1Q00587 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDC42EP1Q00587 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDC42EP1Q00587 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDC42EP1Q00587 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CDC42EP1Q00587 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDC42EP1Q00587 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CDC42EP1Q00587 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDC42EP1Q00587 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CDC42EP1Q00587 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDC42EP1Q00587 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDC42EP1Q00587 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
CDC42EP1Q00587 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.05
CDC42EP1Q00587 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
CDC42EP1Q00587 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDC42EP1Q00587 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDC42EP1Q00587 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDC42EP1Q00587 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDC42EP1Q00587 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDC42EP1Q00587 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
CDC42EP1Q00587 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDC42EP1Q00587 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDC42EP1Q00587 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDC42EP1Q00587 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDC42EP1Q00587 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDC42EP1Q00587 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CDC42EP1Q00587 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CDC42EP1Q00587 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDC42EP1Q00587 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CDC42EP1Q00587 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.85■■■□□ 2.05
CDC42EP1Q00587 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDC42EP1Q00587 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDC42EP1Q00587 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDC42EP1Q00587 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
CDC42EP1Q00587 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDC42EP1Q00587 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CDC42EP1Q00587 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CDC42EP1Q00587 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDC42EP1Q00587 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDC42EP1Q00587 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CDC42EP1Q00587 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDC42EP1Q00587 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
CDC42EP1Q00587 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CDC42EP1Q00587 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDC42EP1Q00587 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
CDC42EP1Q00587 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
CDC42EP1Q00587 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDC42EP1Q00587 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CDC42EP1Q00587 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
CDC42EP1Q00587 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25 ms