Protein–RNA interactions for Protein: P78347

GTF2I, General transcription factor II-I, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2IP78347 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
GTF2IP78347 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
GTF2IP78347 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
GTF2IP78347 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC31.02■■■□□ 2.56
GTF2IP78347 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.02■■■□□ 2.56
GTF2IP78347 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC31.02■■■□□ 2.56
GTF2IP78347 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
GTF2IP78347 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.01■■■□□ 2.55
GTF2IP78347 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
GTF2IP78347 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
GTF2IP78347 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31■■■□□ 2.55
GTF2IP78347 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
GTF2IP78347 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
GTF2IP78347 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
GTF2IP78347 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
GTF2IP78347 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
GTF2IP78347 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
GTF2IP78347 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
GTF2IP78347 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC30.97■■■□□ 2.55
GTF2IP78347 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
GTF2IP78347 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
GTF2IP78347 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
GTF2IP78347 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.96■■■□□ 2.55
GTF2IP78347 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
GTF2IP78347 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
GTF2IP78347 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
GTF2IP78347 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
GTF2IP78347 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
GTF2IP78347 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
GTF2IP78347 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
GTF2IP78347 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
GTF2IP78347 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
GTF2IP78347 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
GTF2IP78347 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
GTF2IP78347 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
GTF2IP78347 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
GTF2IP78347 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
GTF2IP78347 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
GTF2IP78347 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC30.92■■■□□ 2.54
GTF2IP78347 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
GTF2IP78347 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
GTF2IP78347 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
GTF2IP78347 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
GTF2IP78347 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
GTF2IP78347 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
GTF2IP78347 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
GTF2IP78347 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
GTF2IP78347 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
GTF2IP78347 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC30.9■■■□□ 2.54
GTF2IP78347 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
GTF2IP78347 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC30.9■■■□□ 2.54
GTF2IP78347 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
GTF2IP78347 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
GTF2IP78347 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC30.89■■■□□ 2.54
GTF2IP78347 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
GTF2IP78347 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC30.87■■■□□ 2.53
GTF2IP78347 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC30.87■■■□□ 2.53
GTF2IP78347 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
GTF2IP78347 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
GTF2IP78347 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC30.85■■■□□ 2.53
GTF2IP78347 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
GTF2IP78347 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
GTF2IP78347 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
GTF2IP78347 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
GTF2IP78347 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
GTF2IP78347 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC30.84■■■□□ 2.53
GTF2IP78347 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
GTF2IP78347 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.83■■■□□ 2.53
GTF2IP78347 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
GTF2IP78347 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC30.83■■■□□ 2.53
GTF2IP78347 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
GTF2IP78347 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
GTF2IP78347 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
GTF2IP78347 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
GTF2IP78347 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
GTF2IP78347 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC30.81■■■□□ 2.52
GTF2IP78347 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.81■■■□□ 2.52
GTF2IP78347 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
GTF2IP78347 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
GTF2IP78347 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC30.8■■■□□ 2.52
GTF2IP78347 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC30.8■■■□□ 2.52
GTF2IP78347 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
GTF2IP78347 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
GTF2IP78347 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
GTF2IP78347 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
GTF2IP78347 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
GTF2IP78347 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
GTF2IP78347 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
GTF2IP78347 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
GTF2IP78347 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC30.76■■■□□ 2.51
GTF2IP78347 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
GTF2IP78347 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC30.75■■■□□ 2.51
GTF2IP78347 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
GTF2IP78347 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
GTF2IP78347 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
GTF2IP78347 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC30.74■■■□□ 2.51
GTF2IP78347 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
GTF2IP78347 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
GTF2IP78347 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
GTF2IP78347 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81 ms