Protein–RNA interactions for Protein: P78334

GABRE, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit epsilon, humanhuman

Predictions only

Length 506 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABREP78334 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
GABREP78334 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
GABREP78334 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
GABREP78334 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
GABREP78334 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GABREP78334 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
GABREP78334 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GABREP78334 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
GABREP78334 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
GABREP78334 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GABREP78334 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GABREP78334 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GABREP78334 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GABREP78334 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GABREP78334 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
GABREP78334 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
GABREP78334 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GABREP78334 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GABREP78334 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
GABREP78334 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
GABREP78334 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
GABREP78334 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GABREP78334 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
GABREP78334 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
GABREP78334 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GABREP78334 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GABREP78334 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
GABREP78334 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
GABREP78334 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABREP78334 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GABREP78334 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
GABREP78334 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
GABREP78334 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABREP78334 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABREP78334 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABREP78334 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABREP78334 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABREP78334 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABREP78334 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABREP78334 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABREP78334 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
GABREP78334 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABREP78334 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABREP78334 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABREP78334 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
GABREP78334 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABREP78334 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABREP78334 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
GABREP78334 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABREP78334 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABREP78334 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABREP78334 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABREP78334 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABREP78334 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
GABREP78334 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABREP78334 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
GABREP78334 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABREP78334 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABREP78334 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
GABREP78334 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABREP78334 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABREP78334 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
GABREP78334 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GABREP78334 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GABREP78334 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
GABREP78334 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GABREP78334 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
GABREP78334 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GABREP78334 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
GABREP78334 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GABREP78334 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GABREP78334 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GABREP78334 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
GABREP78334 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GABREP78334 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
GABREP78334 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GABREP78334 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GABREP78334 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
GABREP78334 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GABREP78334 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
GABREP78334 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
GABREP78334 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
GABREP78334 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GABREP78334 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GABREP78334 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
GABREP78334 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GABREP78334 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GABREP78334 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GABREP78334 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
GABREP78334 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
GABREP78334 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GABREP78334 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
GABREP78334 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GABREP78334 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
GABREP78334 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GABREP78334 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
GABREP78334 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GABREP78334 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
GABREP78334 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
GABREP78334 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.5 ms