Protein–RNA interactions for Protein: P63145

ERVK-24, Endogenous retrovirus group K member 24 Gag polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-24P63145 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
ERVK-24P63145 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
ERVK-24P63145 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ERVK-24P63145 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
ERVK-24P63145 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ERVK-24P63145 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
ERVK-24P63145 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
ERVK-24P63145 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
ERVK-24P63145 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ERVK-24P63145 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ERVK-24P63145 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
ERVK-24P63145 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
ERVK-24P63145 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
ERVK-24P63145 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ERVK-24P63145 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ERVK-24P63145 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
ERVK-24P63145 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
ERVK-24P63145 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
ERVK-24P63145 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.61■■■□□ 2.33
ERVK-24P63145 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ERVK-24P63145 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.61■■■□□ 2.33
ERVK-24P63145 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
ERVK-24P63145 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ERVK-24P63145 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ERVK-24P63145 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.6■■■□□ 2.33
ERVK-24P63145 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.6■■■□□ 2.33
ERVK-24P63145 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ERVK-24P63145 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ERVK-24P63145 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
ERVK-24P63145 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
ERVK-24P63145 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ERVK-24P63145 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
ERVK-24P63145 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ERVK-24P63145 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
ERVK-24P63145 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ERVK-24P63145 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
ERVK-24P63145 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
ERVK-24P63145 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
ERVK-24P63145 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
ERVK-24P63145 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ERVK-24P63145 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
ERVK-24P63145 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
ERVK-24P63145 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ERVK-24P63145 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ERVK-24P63145 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
ERVK-24P63145 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
ERVK-24P63145 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
ERVK-24P63145 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.52■■■□□ 2.32
ERVK-24P63145 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC29.51■■■□□ 2.31
ERVK-24P63145 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
ERVK-24P63145 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ERVK-24P63145 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
ERVK-24P63145 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
ERVK-24P63145 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
ERVK-24P63145 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ERVK-24P63145 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ERVK-24P63145 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.48■■■□□ 2.31
ERVK-24P63145 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
ERVK-24P63145 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
ERVK-24P63145 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ERVK-24P63145 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ERVK-24P63145 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ERVK-24P63145 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ERVK-24P63145 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ERVK-24P63145 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
ERVK-24P63145 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
ERVK-24P63145 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.46■■■□□ 2.31
ERVK-24P63145 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
ERVK-24P63145 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ERVK-24P63145 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ERVK-24P63145 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
ERVK-24P63145 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ERVK-24P63145 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.45■■■□□ 2.31
ERVK-24P63145 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
ERVK-24P63145 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
ERVK-24P63145 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.45■■■□□ 2.3
ERVK-24P63145 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
ERVK-24P63145 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.44■■■□□ 2.3
ERVK-24P63145 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ERVK-24P63145 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ERVK-24P63145 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ERVK-24P63145 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ERVK-24P63145 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ERVK-24P63145 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC29.43■■■□□ 2.3
ERVK-24P63145 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ERVK-24P63145 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ERVK-24P63145 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
ERVK-24P63145 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
ERVK-24P63145 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.42■■■□□ 2.3
ERVK-24P63145 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ERVK-24P63145 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
ERVK-24P63145 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
ERVK-24P63145 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ERVK-24P63145 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ERVK-24P63145 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ERVK-24P63145 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC29.4■■■□□ 2.3
ERVK-24P63145 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ERVK-24P63145 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
ERVK-24P63145 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
ERVK-24P63145 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.39■■■□□ 2.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms