Protein–RNA interactions for Protein: P62256

UBE2H, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 H, humanhuman

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2HP62256 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
UBE2HP62256 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
UBE2HP62256 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
UBE2HP62256 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
UBE2HP62256 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
UBE2HP62256 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
UBE2HP62256 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
UBE2HP62256 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
UBE2HP62256 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
UBE2HP62256 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
UBE2HP62256 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
UBE2HP62256 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
UBE2HP62256 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
UBE2HP62256 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
UBE2HP62256 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
UBE2HP62256 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC29.01■■■□□ 2.24
UBE2HP62256 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
UBE2HP62256 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
UBE2HP62256 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
UBE2HP62256 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
UBE2HP62256 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
UBE2HP62256 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
UBE2HP62256 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
UBE2HP62256 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC29■■■□□ 2.23
UBE2HP62256 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
UBE2HP62256 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
UBE2HP62256 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
UBE2HP62256 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
UBE2HP62256 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
UBE2HP62256 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
UBE2HP62256 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
UBE2HP62256 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
UBE2HP62256 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
UBE2HP62256 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
UBE2HP62256 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
UBE2HP62256 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
UBE2HP62256 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.96■■■□□ 2.23
UBE2HP62256 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
UBE2HP62256 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
UBE2HP62256 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
UBE2HP62256 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
UBE2HP62256 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
UBE2HP62256 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
UBE2HP62256 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
UBE2HP62256 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
UBE2HP62256 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
UBE2HP62256 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
UBE2HP62256 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
UBE2HP62256 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
UBE2HP62256 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
UBE2HP62256 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
UBE2HP62256 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
UBE2HP62256 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
UBE2HP62256 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
UBE2HP62256 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
UBE2HP62256 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
UBE2HP62256 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
UBE2HP62256 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
UBE2HP62256 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
UBE2HP62256 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
UBE2HP62256 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.21
UBE2HP62256 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC28.89■■■□□ 2.21
UBE2HP62256 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
UBE2HP62256 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
UBE2HP62256 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
UBE2HP62256 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
UBE2HP62256 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
UBE2HP62256 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
UBE2HP62256 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
UBE2HP62256 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
UBE2HP62256 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
UBE2HP62256 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
UBE2HP62256 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
UBE2HP62256 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
UBE2HP62256 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
UBE2HP62256 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
UBE2HP62256 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
UBE2HP62256 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
UBE2HP62256 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
UBE2HP62256 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
UBE2HP62256 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
UBE2HP62256 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
UBE2HP62256 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
UBE2HP62256 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
UBE2HP62256 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
UBE2HP62256 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
UBE2HP62256 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
UBE2HP62256 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
UBE2HP62256 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
UBE2HP62256 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
UBE2HP62256 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
UBE2HP62256 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
UBE2HP62256 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
UBE2HP62256 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
UBE2HP62256 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
UBE2HP62256 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
UBE2HP62256 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
UBE2HP62256 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
UBE2HP62256 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
UBE2HP62256 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 168.7 ms