Protein–RNA interactions for Protein: P55212

CASP6, Caspase-6, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP6P55212 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP6P55212 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CASP6P55212 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP6P55212 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CASP6P55212 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP6P55212 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP6P55212 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP6P55212 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CASP6P55212 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP6P55212 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP6P55212 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP6P55212 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP6P55212 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP6P55212 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CASP6P55212 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP6P55212 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP6P55212 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP6P55212 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP6P55212 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP6P55212 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP6P55212 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CASP6P55212 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASP6P55212 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
CASP6P55212 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASP6P55212 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASP6P55212 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
CASP6P55212 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
CASP6P55212 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASP6P55212 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASP6P55212 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
CASP6P55212 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP6P55212 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP6P55212 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP6P55212 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP6P55212 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
CASP6P55212 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASP6P55212 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASP6P55212 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASP6P55212 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
CASP6P55212 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP6P55212 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP6P55212 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP6P55212 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP6P55212 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
CASP6P55212 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
CASP6P55212 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASP6P55212 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASP6P55212 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASP6P55212 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASP6P55212 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
CASP6P55212 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP6P55212 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP6P55212 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP6P55212 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP6P55212 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
CASP6P55212 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP6P55212 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP6P55212 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP6P55212 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP6P55212 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CASP6P55212 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP6P55212 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CASP6P55212 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASP6P55212 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASP6P55212 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASP6P55212 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASP6P55212 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASP6P55212 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CASP6P55212 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CASP6P55212 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CASP6P55212 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CASP6P55212 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
CASP6P55212 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CASP6P55212 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
CASP6P55212 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CASP6P55212 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASP6P55212 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASP6P55212 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASP6P55212 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CASP6P55212 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CASP6P55212 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP6P55212 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP6P55212 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP6P55212 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP6P55212 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CASP6P55212 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP6P55212 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP6P55212 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP6P55212 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP6P55212 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP6P55212 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP6P55212 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CASP6P55212 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
CASP6P55212 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASP6P55212 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASP6P55212 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
CASP6P55212 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP6P55212 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP6P55212 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
CASP6P55212 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.8 ms