Protein–RNA interactions for Protein: P53396

ACLY, ATP-citrate synthase, humanhuman

Predictions only

Length 1,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACLYP53396 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
ACLYP53396 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ACLYP53396 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ACLYP53396 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
ACLYP53396 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC28.56■■■□□ 2.16
ACLYP53396 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ACLYP53396 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ACLYP53396 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ACLYP53396 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.54■■■□□ 2.16
ACLYP53396 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
ACLYP53396 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
ACLYP53396 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ACLYP53396 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ACLYP53396 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ACLYP53396 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ACLYP53396 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ACLYP53396 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ACLYP53396 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ACLYP53396 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ACLYP53396 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.16
ACLYP53396 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ACLYP53396 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ACLYP53396 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
ACLYP53396 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ACLYP53396 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ACLYP53396 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ACLYP53396 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
ACLYP53396 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ACLYP53396 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ACLYP53396 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ACLYP53396 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
ACLYP53396 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ACLYP53396 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ACLYP53396 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ACLYP53396 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ACLYP53396 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ACLYP53396 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
ACLYP53396 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ACLYP53396 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ACLYP53396 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
ACLYP53396 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ACLYP53396 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
ACLYP53396 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ACLYP53396 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ACLYP53396 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ACLYP53396 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ACLYP53396 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ACLYP53396 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ACLYP53396 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
ACLYP53396 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ACLYP53396 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
ACLYP53396 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
ACLYP53396 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ACLYP53396 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ACLYP53396 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ACLYP53396 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ACLYP53396 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ACLYP53396 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ACLYP53396 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ACLYP53396 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ACLYP53396 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ACLYP53396 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ACLYP53396 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
ACLYP53396 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
ACLYP53396 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ACLYP53396 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ACLYP53396 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ACLYP53396 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ACLYP53396 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ACLYP53396 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ACLYP53396 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ACLYP53396 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ACLYP53396 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
ACLYP53396 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ACLYP53396 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ACLYP53396 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
ACLYP53396 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ACLYP53396 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ACLYP53396 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ACLYP53396 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ACLYP53396 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ACLYP53396 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ACLYP53396 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
ACLYP53396 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ACLYP53396 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
ACLYP53396 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
ACLYP53396 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
ACLYP53396 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ACLYP53396 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
ACLYP53396 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
ACLYP53396 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ACLYP53396 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
ACLYP53396 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
ACLYP53396 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
ACLYP53396 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
ACLYP53396 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ACLYP53396 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ACLYP53396 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
ACLYP53396 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
ACLYP53396 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms