Protein–RNA interactions for Protein: P52849

NDST2, Bifunctional heparan sulfate N-deacetylase/N-sulfotransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 883 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDST2P52849 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NDST2P52849 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
NDST2P52849 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NDST2P52849 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NDST2P52849 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NDST2P52849 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NDST2P52849 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NDST2P52849 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NDST2P52849 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NDST2P52849 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC26.09■■□□□ 1.77
NDST2P52849 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NDST2P52849 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NDST2P52849 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NDST2P52849 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NDST2P52849 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NDST2P52849 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
NDST2P52849 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NDST2P52849 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NDST2P52849 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NDST2P52849 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NDST2P52849 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NDST2P52849 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NDST2P52849 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC26.06■■□□□ 1.76
NDST2P52849 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NDST2P52849 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NDST2P52849 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NDST2P52849 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NDST2P52849 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NDST2P52849 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NDST2P52849 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NDST2P52849 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NDST2P52849 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NDST2P52849 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NDST2P52849 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NDST2P52849 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NDST2P52849 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NDST2P52849 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NDST2P52849 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NDST2P52849 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NDST2P52849 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NDST2P52849 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NDST2P52849 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
NDST2P52849 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NDST2P52849 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NDST2P52849 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NDST2P52849 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
NDST2P52849 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NDST2P52849 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
NDST2P52849 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
NDST2P52849 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NDST2P52849 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
NDST2P52849 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NDST2P52849 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NDST2P52849 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC26■■□□□ 1.75
NDST2P52849 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NDST2P52849 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NDST2P52849 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NDST2P52849 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NDST2P52849 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
NDST2P52849 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NDST2P52849 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NDST2P52849 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NDST2P52849 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NDST2P52849 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NDST2P52849 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NDST2P52849 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NDST2P52849 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NDST2P52849 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NDST2P52849 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
NDST2P52849 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.75
NDST2P52849 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
NDST2P52849 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NDST2P52849 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NDST2P52849 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NDST2P52849 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NDST2P52849 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NDST2P52849 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NDST2P52849 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NDST2P52849 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NDST2P52849 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NDST2P52849 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NDST2P52849 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NDST2P52849 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NDST2P52849 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
NDST2P52849 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
NDST2P52849 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NDST2P52849 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NDST2P52849 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
NDST2P52849 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
NDST2P52849 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NDST2P52849 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NDST2P52849 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NDST2P52849 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NDST2P52849 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NDST2P52849 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
NDST2P52849 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
NDST2P52849 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
NDST2P52849 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NDST2P52849 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NDST2P52849 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 70.2 ms