Protein–RNA interactions for Protein: P51797

CLCN6, Chloride transport protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN6P51797 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLCN6P51797 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLCN6P51797 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLCN6P51797 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLCN6P51797 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLCN6P51797 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
CLCN6P51797 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLCN6P51797 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
CLCN6P51797 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLCN6P51797 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
CLCN6P51797 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLCN6P51797 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLCN6P51797 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLCN6P51797 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLCN6P51797 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
CLCN6P51797 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
CLCN6P51797 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
CLCN6P51797 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLCN6P51797 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLCN6P51797 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLCN6P51797 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLCN6P51797 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLCN6P51797 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
CLCN6P51797 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
CLCN6P51797 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLCN6P51797 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLCN6P51797 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLCN6P51797 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
CLCN6P51797 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLCN6P51797 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLCN6P51797 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
CLCN6P51797 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
CLCN6P51797 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLCN6P51797 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLCN6P51797 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
CLCN6P51797 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLCN6P51797 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLCN6P51797 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLCN6P51797 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLCN6P51797 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
CLCN6P51797 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
CLCN6P51797 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLCN6P51797 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLCN6P51797 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
CLCN6P51797 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLCN6P51797 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLCN6P51797 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLCN6P51797 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLCN6P51797 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLCN6P51797 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLCN6P51797 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLCN6P51797 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
CLCN6P51797 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLCN6P51797 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLCN6P51797 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLCN6P51797 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
CLCN6P51797 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLCN6P51797 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
CLCN6P51797 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLCN6P51797 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLCN6P51797 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
CLCN6P51797 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLCN6P51797 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLCN6P51797 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLCN6P51797 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLCN6P51797 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLCN6P51797 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLCN6P51797 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
CLCN6P51797 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLCN6P51797 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLCN6P51797 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLCN6P51797 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLCN6P51797 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
CLCN6P51797 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLCN6P51797 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLCN6P51797 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLCN6P51797 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
CLCN6P51797 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLCN6P51797 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLCN6P51797 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
CLCN6P51797 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLCN6P51797 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLCN6P51797 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
CLCN6P51797 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLCN6P51797 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLCN6P51797 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLCN6P51797 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
CLCN6P51797 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLCN6P51797 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27■■□□□ 1.91
CLCN6P51797 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLCN6P51797 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
CLCN6P51797 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
CLCN6P51797 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLCN6P51797 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLCN6P51797 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLCN6P51797 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLCN6P51797 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLCN6P51797 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLCN6P51797 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
CLCN6P51797 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.6 ms