Protein–RNA interactions for Protein: P51790

CLCN3, H(+)/Cl(-) exchange transporter 3, humanhuman

Predictions only

Length 818 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLCN3P51790 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLCN3P51790 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLCN3P51790 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CLCN3P51790 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLCN3P51790 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLCN3P51790 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLCN3P51790 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLCN3P51790 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLCN3P51790 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CLCN3P51790 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CLCN3P51790 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CLCN3P51790 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CLCN3P51790 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CLCN3P51790 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
CLCN3P51790 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLCN3P51790 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLCN3P51790 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLCN3P51790 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CLCN3P51790 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLCN3P51790 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLCN3P51790 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLCN3P51790 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLCN3P51790 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CLCN3P51790 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
CLCN3P51790 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLCN3P51790 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLCN3P51790 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLCN3P51790 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLCN3P51790 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLCN3P51790 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CLCN3P51790 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
CLCN3P51790 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
CLCN3P51790 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLCN3P51790 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CLCN3P51790 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CLCN3P51790 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
CLCN3P51790 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CLCN3P51790 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
CLCN3P51790 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLCN3P51790 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLCN3P51790 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLCN3P51790 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLCN3P51790 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLCN3P51790 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CLCN3P51790 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLCN3P51790 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
CLCN3P51790 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
CLCN3P51790 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
CLCN3P51790 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLCN3P51790 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLCN3P51790 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLCN3P51790 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLCN3P51790 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
CLCN3P51790 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLCN3P51790 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
CLCN3P51790 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLCN3P51790 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.09■■■□□ 2.09
CLCN3P51790 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLCN3P51790 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
CLCN3P51790 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CLCN3P51790 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLCN3P51790 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.07■■■□□ 2.08
CLCN3P51790 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLCN3P51790 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
CLCN3P51790 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
CLCN3P51790 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLCN3P51790 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
CLCN3P51790 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLCN3P51790 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLCN3P51790 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLCN3P51790 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
CLCN3P51790 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
CLCN3P51790 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLCN3P51790 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLCN3P51790 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLCN3P51790 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLCN3P51790 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLCN3P51790 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLCN3P51790 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CLCN3P51790 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLCN3P51790 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLCN3P51790 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CLCN3P51790 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CLCN3P51790 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLCN3P51790 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLCN3P51790 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CLCN3P51790 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CLCN3P51790 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CLCN3P51790 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CLCN3P51790 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLCN3P51790 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CLCN3P51790 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLCN3P51790 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLCN3P51790 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLCN3P51790 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLCN3P51790 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CLCN3P51790 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CLCN3P51790 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CLCN3P51790 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CLCN3P51790 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 92.7 ms