Protein–RNA interactions for Protein: P49642

PRIM1, DNA primase small subunit, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRIM1P49642 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
PRIM1P49642 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
PRIM1P49642 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
PRIM1P49642 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
PRIM1P49642 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
PRIM1P49642 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PRIM1P49642 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PRIM1P49642 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
PRIM1P49642 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
PRIM1P49642 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PRIM1P49642 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PRIM1P49642 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
PRIM1P49642 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.48■■■□□ 2.95
PRIM1P49642 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PRIM1P49642 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PRIM1P49642 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
PRIM1P49642 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
PRIM1P49642 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PRIM1P49642 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PRIM1P49642 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC33.45■■■□□ 2.95
PRIM1P49642 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
PRIM1P49642 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PRIM1P49642 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PRIM1P49642 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PRIM1P49642 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PRIM1P49642 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PRIM1P49642 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PRIM1P49642 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.43■■■□□ 2.94
PRIM1P49642 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PRIM1P49642 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.42■■■□□ 2.94
PRIM1P49642 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PRIM1P49642 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC33.41■■■□□ 2.94
PRIM1P49642 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
PRIM1P49642 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC33.41■■■□□ 2.94
PRIM1P49642 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
PRIM1P49642 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC33.4■■■□□ 2.94
PRIM1P49642 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PRIM1P49642 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
PRIM1P49642 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PRIM1P49642 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PRIM1P49642 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PRIM1P49642 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PRIM1P49642 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
PRIM1P49642 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
PRIM1P49642 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
PRIM1P49642 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC33.38■■■□□ 2.93
PRIM1P49642 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC33.38■■■□□ 2.93
PRIM1P49642 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PRIM1P49642 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PRIM1P49642 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC33.37■■■□□ 2.93
PRIM1P49642 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
PRIM1P49642 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC33.35■■■□□ 2.93
PRIM1P49642 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PRIM1P49642 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.35■■■□□ 2.93
PRIM1P49642 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PRIM1P49642 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PRIM1P49642 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PRIM1P49642 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
PRIM1P49642 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PRIM1P49642 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC33.34■■■□□ 2.93
PRIM1P49642 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC33.34■■■□□ 2.93
PRIM1P49642 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
PRIM1P49642 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
PRIM1P49642 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
PRIM1P49642 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.34■■■□□ 2.93
PRIM1P49642 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.33■■■□□ 2.93
PRIM1P49642 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC33.32■■■□□ 2.92
PRIM1P49642 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PRIM1P49642 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.31■■■□□ 2.92
PRIM1P49642 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.31■■■□□ 2.92
PRIM1P49642 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC33.29■■■□□ 2.92
PRIM1P49642 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC33.29■■■□□ 2.92
PRIM1P49642 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.29■■■□□ 2.92
PRIM1P49642 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PRIM1P49642 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PRIM1P49642 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
PRIM1P49642 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
PRIM1P49642 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC33.26■■■□□ 2.91
PRIM1P49642 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PRIM1P49642 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PRIM1P49642 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PRIM1P49642 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC33.25■■■□□ 2.91
PRIM1P49642 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC33.25■■■□□ 2.91
PRIM1P49642 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
PRIM1P49642 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
PRIM1P49642 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
PRIM1P49642 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
PRIM1P49642 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
PRIM1P49642 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
PRIM1P49642 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
PRIM1P49642 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
PRIM1P49642 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PRIM1P49642 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
PRIM1P49642 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PRIM1P49642 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PRIM1P49642 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PRIM1P49642 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
PRIM1P49642 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC33.21■■■□□ 2.91
PRIM1P49642 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
PRIM1P49642 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms